黄燕，陈宇，米荣升，左佳坤，王志豪，韩先干，刘永杰，陈兆国*

(1. 南京农业大学动物医学院/动物健康与食品安全国际联合实验室，江苏 南京 210095；2. 中国农业科学院上海兽医研究所/农业农村部动物寄生虫重点实验室/农业农村部动物产品质量安全生物性危害因子风险评估实验室(上海)，上海 200241)

伴随规模化养鸡业的蓬勃发展，集约化养殖造成寄生虫、细菌和病毒等感染的状况日益严重，给养鸡业带来严重的经济损失。贝氏隐孢子虫(Cryptosporidiumbaileyi，C.baileyi)是感染鸡的优势虫种，主要侵犯呼吸道、法氏囊、肠道和泄殖腔等部位[1-2]。有报道称雏鸡感染贝氏隐孢子虫后造成新城疫疫苗和禽流感疫苗的接种失败[3]。禽致病性大肠杆菌(avian pathogenicEscherichiacoli，APEC)是危害养禽业的重要传染病病原之一[4]，有非常高的传染率和死亡率。这两种病原体常常共同感染鸡群，与禽类的“肠毒综合征”[5]密切相关。

胃肠道微生物群落(microbial community in gastrointestinal tract)对动物健康起重要作用。众多研究报道，肠道菌群在营养吸收、饲料消化和免疫调节等方面发挥关键作用[6-10]。近年来，对肠道寄生虫与菌群相互作用研究发现，原虫或蠕虫感染均可导致肠道微生物组成和多样性的改变，对宿主的具体致病作用和影响则与虫种有关[11]。此外，部分肠道菌群也影响致病菌对机体的感染与危害。对肠道菌群的综合分析可以更好地了解致病微生物之间的互作和多样性，而目前关于贝氏隐孢子虫单独以及合并感染大肠杆菌后宿主肠道菌群的变化还未见报道。……