尾叶紫薇全长转录组测序及微卫星标记开发
2021-09-29吴宜静张一鸣陆泓锦赵天祎蔡军火潘会堂张启翔
章 寒,吴宜静,张一鸣,续 言,陆泓锦,赵天祎,蔡 明*,张 曼,蔡军火,潘会堂,张启翔
(1.北京林业大学 花卉种质创新与分子育种北京市重点实验室/国家花卉工程技术研究中心/城乡生态环境北京实验室/园林环境教育部工程研究中心/林木花卉遗传育种教育部重点实验室/园林学院,北京 100083;2.江西农业大学 园林与艺术学院,江西 南昌 330045)
【研究意义】尾叶紫薇(Lagerstroemia caudata)原产中国,属千屈菜科(Lythraceae)紫薇属(Lagerstroemia),是该属唯一被证明具有花香的物种,也是培育香花紫薇新品种的重要育种亲本[1-2]。广泛了解尾叶紫薇花香物质合成相关基因并开发大量分子标记,将为紫薇花香遗传改良奠定基础。【前人研究进展】近年来,关于尾叶紫薇的研究已在杂交育种、遗传多样性、花香成分及释香规律、香气物质生物合成与代谢等方面开展,但在分子生物学层面上的研究依旧不够深入,缺乏对功能基因的系统了解[1-5]。而尾叶紫薇已有的二代转录组测序数据,受限于读长短的技术问题,部分转录本不能代表全长cDNA,序列信息不够全面。微卫星序列又名简单重复序列(simple sequence repeat,SSR),是研究植物遗传多样性的重要分子标记之一[6]。在尾叶紫薇微卫星标记相关报道里,研究者以尾叶紫薇为材料通过磁珠富集法开发了60 个尾叶紫薇SSR 分子标记并获得18 对多态性引物[7],以紫薇为材料得到在尾叶紫薇中通用的65 对多态性引物,并获得6 个与叶片大小、地径、株高性状连锁的SSR 位点[8-10]。目前与尾叶紫薇花香性状连锁的SSR 标记尚未见报道,且数量远远无法满足分子育种研究的需要。……
