程欣

摘要：为了解番茄OFP基因家族的功能特征，通过生物信息学手段对番茄OFP基因家族成员进行全面的生物信息学分析，包括染色体定位、基因结构、蛋白质理化性质、二级结构、三维构象、启动子分析、亲缘关系及组织特异性分析。结果表明，番茄中的31个OFP基因在12条染色体上呈不均匀分布;除SlOFP6、SlOFP7、SlOFP12、SlOFP13基因以外，其余27个OFP基因均不含有内含子结构。蛋白质理化性质分析结果表明，大部分OFP蛋白为不稳定性蛋白，并且54.8%的OFP蛋白分布于细胞核中。蛋白质二级结构和三维构象显示，番茄OFP蛋白以α-螺旋和无规则卷曲为主要组成成分，表明番茄OFP蛋白之间存在保守性。启动子顺式作用元件分析结果表明，番茄OFP基因启动子上主要存在3类元件：光响应、激素响应应答以及逆境胁迫响应元件。而组织特异性分析结果表明，番茄OFP基因在各组织中的表达量差异较大，预示着番茄OFP基因生物学功能的多样性。分析结果将为后续研究番茄OFP基因家族成员的生物学功能提供参考。

关键词：番茄（Solanum lycopersicum）;OFP基因家族;生物信息学分析;蛋白质理化性质;蛋白结构

中图分类号：S641.201;Q78   文献标志码： A

文章编号：1002-1302（2021）18-0039-09

收稿日期：2021-01-29

基金项目：重庆市科委自然科学基金（编号：cstc2018jcyjAX0458）。

作者简介：程 欣（1996—），女，四川广安人，硕士研究生，主要从事番茄功能基因的克隆与应用研究。E-mail：chengxin599@163.com。

番茄（Solanum lycopersicum）原产于南美洲，是管状花目茄科番茄属的一种一年生或多年生草本植物，是兼具营养价值和商业价值的一种蔬菜作物，是植物分子生物研究的一种模式植物。……