四川地区藏猪戊型肝炎病毒的检测和遗传演化分析
2021-09-27杨丹娇张朝辉
曹 慧,杨丹娇,张 敏,李 平,张朝辉,汤 承,2,张 斌,2*
(1.西南民族大学畜牧兽医学院,成都 610041;2.国家民族事务委员会青藏高原动物疫病防控创新团队,成都 610041;3.四川省甘孜藏族自治州畜牧业科学研究所,康定 626000;4.四川省甘孜藏族自治州动物疫病预防控制中心,康定 626000)
戊型肝炎(hepatitis E,HE)是由戊型肝炎病毒(hepatitis E Virus,HEV)引起的一种人和多种动物患病的人兽共患病,一般经粪口途径传播。人HE在发展中国家和地区发病率达80%以上,致死率为1%左右,怀孕期为6~8月的孕妇死亡率可达20%[1]。目前在我国HE仍以散发形式流行[2]。过去认为HE流行地区主要分布在发展中国家[3-4],但是近年来在美国、法国、新西兰、澳大利亚等发达国家亦有散发病例报道[5-6]。人们在猪、羊、老鼠等动物中相继检测到戊肝病毒[7-9]。
HEV是一种正链单股RNA病毒,属于肝炎病毒科正嗜肝病毒属[10]。编码区由3个部分重叠的开放式阅读框(ORF1、ORF2 和ORF3)组成。由于该病毒能感染多种动物宿主,跨物种感染很常见,因此HEV的基因组表现出显著的多样性。基于这种序列多样性,被分为至少8种基因型(1-8)[11-13]。1型和2型HEV仅感染人类,在发展中国家,由于饮用污染的饮用水而呈地方性流行[14-15],基因型3和4主要感染人和各种动物,5型和6型主要感野猪,新发现的7型流行病学分布还不明确,而8型是2016年在我国双峰骆驼中发现的另一种新的基因型[11];这些类型的HEV可通过人畜共患病传播,在世界范围内引起感染[16]。在我国,基因4型HEV(HEV-4)是主要流行基因型,参与人畜共患传播[17],目前已在人和动物中鉴定出9种HEV-4的亚型(HEV-4a至HEV-4i)[18]。……
