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基于网络药理学探究丹参-骨碎补药对治疗股骨头坏死的作用机制

2021-09-26仇湘中张信成尹晨东

中国医药导报 2021年24期
关键词:数据库

陈 中 郑 阳 仇湘中 张信成 尹晨东

1.湖南中医药大学研究生院,湖南长沙 410006;2.湖南省中医药研究院附属医院骨伤科,湖南长沙 410006

股骨头坏死是指因各种原因导致股骨头血供中断或减少,引起局部骨细胞缺血、变性、坏死,骨结构破坏,最终导致股骨头塌陷的严重骨关节炎[1]。我国股骨头坏死发病率逐渐年轻化[2]。洪坤豪等[3]、王丹丹等[4]、黄佳敏等[5]采用数据挖掘技术发现丹参、骨碎补出现频率较高,郭会卿、仇湘中等骨伤名家也将丹参、骨碎补作为其治疗股骨头坏死的核心药对[6-7]。由此可见,丹参-骨碎补药对在中医药治疗股骨头坏死处方中有重要作用。

1 资料与方法

1.1 丹参-骨碎补药对的活性成分和靶点的获取

分别以中药名“丹参”“骨碎补”在中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)数据库下载ingredients、targets;根据ADME 筛选模型,数据标准为口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30,类药性(drug-likeness,DL)≥0.18。将获得的丹参和骨碎补的genesymbol导入UNIPORT 数据库(http://lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php)进行标准化处理。

1.2 股骨头坏死相关靶点的获取

以“Osteonecrosis of the femoral head ”为关键词,物种限定为人类,分别在GeneCards、OMIM 数据库中检索股骨头坏死相关靶点,获取股骨头坏死相关靶点信息。

1.3 丹参-骨碎补药对与股骨头坏死相交靶点的获取

通过R 软件将丹参-骨碎补药对相关潜在靶点与股骨头坏死的潜在靶点取交集并绘制维恩图。

1.4 药物-活性成分-股骨头坏死靶点蛋白互作网络

将丹参-骨碎补药对活性成分及治疗股骨头坏死潜在靶点导入STRING 数据库,选择Multiple protein,限定物种为人,获取靶标蛋白互作网络关系;利用R软件,将蛋白质-蛋白质相互作用(proteinprotein interaction,PPI)数据导入,得知基因的连接节点数,绘制丹参-骨碎补治疗股骨头坏死的关键靶点图。……

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