ADH家族在肝细胞癌中的表达及其临床意义
2021-09-25帕成周邬善敏
帕成周,邬善敏
(武汉大学人民医院肝胆外科,湖北武汉 430060)
原发性肝癌是全球第4位常见的癌症死亡原因,发病率位居第6位;是我国是第4位常见恶性肿瘤及第2位肿瘤致死病因[1,2]。其中肝细胞癌(hepa‑tocellular carcinoma,HCC)占所有原发性肝癌病例的90%,该病早期检测困难,进展为晚期后恶性程度高,发展迅速,预后差。目前,我国肝硬化主要病因是病毒性肝炎,但酒精性肝硬化的比例有所升高[3]。长期大量饮酒与肝脏脂肪变性和肝纤维化有关,最终可以进展为肝硬化,这是发展为HCC的主要危险因素[4]。乙醇脱氢酶(alcoholic dehydroge‑nase,ADH)分为5大类,包括7种基因型,其编码基因(ADH 7、ADH 1C、ADH 1B、ADH 1A、ADH 6、ADH 4和ADH 5)位于四号染色体长臂(4q21‑24)的区域内,长度约为365 kb,基因按上述排列顺序进行转录[5]。ADH在乙醇、视黄醇等物质代谢中发挥着重要的作用,将乙醇氧化为乙醛,若此酶表达异常或失调,会导致酒精代谢异常[6]。近年研究发现ADH家族在胃癌、乳腺癌、鼻咽癌中可以用于评估患病风险及评价疾病预后[7‑9]。本研究利用生物信息学方法探究ADH家族在HCC中的表达情况及其预后评价作用,旨在为ADH家族的实际临床应用提供新思路。
1 资料与方法
1.1 数据来源及整理
癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库(https://portal.gdc.cancer.gov/)收录了超过20 000个原发性肿瘤及与之匹配的正常样本,涵盖了33种癌症类型,共有2.5 P的基因组、表观基因组、转录组和蛋白质组数据。本研究自TCGA数据库下载肝细胞癌和正常肝组织经校正后的RNA‑Seq基因表达谱,提取并整理数据集,此数据集中包含肝细胞癌374例,正常肝组织50例。TCGA数据库下载的临床信息数据集包含377例临床资料,其中240例资料较为完整。……
