基于加权基因共表达网络分析构建胃癌转移预测模型

2021-09-22章德昆谢径峰吴芳华黄玉钿薛玉钦王力群

中国癌症杂志 2021年8期

龚超，陈魁，章德昆，谢径峰，吴芳华，黄玉钿，薛玉钦，王力群

1.福建医科大学附属福州市第一医院普通外科，福建福州 350009；2.福建医科大学附属福州市第一医院检验科，福建福州 350009；3.福建医科大学附属福州市第一医院病理科，福建福州 350009

胃癌是世界上癌症相关性死亡的主要原因之一，中国2015年胃癌发病率和死亡率中均居癌症发病率和相关死亡率的第二位［1］。尽管目前手术结合化疗的方案已广泛应用于胃癌的治疗当中，但胃癌的5年生存率依然较低［2-3］。据文献［4-5］报道，非转移性胃癌患者5年生存率可达60%，但晚期转移性胃癌患者5年生存率不足10%。因此，早期识别具有高危转移因素的胃癌患者，采取更积极的治疗方案具有重要的临床价值。

近年来基因芯片筛选技术广泛应用于临床治疗，同时有研究［6-7］表明，利用基因芯片技术筛选胃癌转移相关基因具有重要价值。同时每例患者的生物调控机制涉及复杂的基因网络互作，仅通过传统的基因芯片筛选差异基因不可否认其可对生物系统的局部作出解释，但难免遗漏调控过程中的核心分子。本研究利用高通量功能基因组数据库（Gene Expression Omnibus，GEO）中含有晚期转移胃癌数据的数据集（GES103236），采用加权基因共表达网络分析（weighted gene co-expression network analysis，WGCNA）方法筛选出与胃癌转移相关的靶基因并构建预测模型，拟为胃癌患者个体化诊疗提供参考依据。