石蜡包埋组织中组蛋白的提取分离和翻译后修饰的定量分析
2021-09-11田姗姗刘冉冉钱晓龙郭晓静
色谱 2021年10期
关键词:分析
田姗姗, 刘冉冉, 钱晓龙, 郭晓静, 张 锴
(1.天津医科大学基础医学院, 天津市医学表观遗传学重点实验室, 天津 300070; 2.天津医科大学肿瘤医院乳腺病理研究室, 教育部乳腺癌防治重点实验室, 国家肿瘤临床医学研究中心, 天津 300060)
组蛋白(histone)是真核生物核小体的主要蛋白质,包括核心组蛋白H2A、H2B、H3、H4以及H1,其翻译后修饰(HPTMs)是一类重要的表观遗传调控因子,在不同生理、病理条件下的基因表达调控中扮演重要角色[1]。近年来,随着蛋白质分离富集技术的快速发展,生物质谱扫描速度、分辨率和灵敏度的不断提高,越来越多的新型组蛋白翻译后修饰被相继发现[2,3],极大地拓展了人们对于组蛋白密码(histone code)的认识。大量研究[4]表明,组蛋白翻译后修饰的异常表达或定位,与肿瘤的发生发展密切相关,因此,全面系统地分析正常组织和病变组织中组蛋白翻译后修饰位点与修饰水平,对于理解组蛋白修饰功能、揭示肿瘤发生机制和标志物,以及寻找药物靶标有着十分重要的意义[5]。
当前对于临床样本的HPTMs研究,往往借助基于抗体的免疫组化等手段,然而这些方法有其自身的局限性,如抗体种类少、难以进行HPTMs系统分析、无法检测组合修饰形式等[6]。而基于质谱的蛋白质组学技术,是解决上述问题的有力工具[7],并已应用于细胞系和动物组织中表观遗传修饰的分析研究中[8,9]。然而体外培养细胞组蛋白翻译后修饰水平的差异并不能够完全反映体内细胞的真实状况,因此从临床病理组织中提取组蛋白并分析其翻译后修饰水平有很重要的意义[10]。……
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