高氨诱导的肝细胞中凋亡相关LncRNA表达谱的变化
2021-09-08杨荟玉张远英周恩慧龚美源孔令建刘冰熔
杨荟玉,张远英,周恩慧,龚美源,孔令建,刘冰熔
1)郑州大学第一附属医院消化内科 郑州 450052 2)郑州大学华大基因学院 郑州 450052 3)郑州大学药学院 郑州 450052
肝功能衰竭(肝衰竭)是严重的进行性肝病。肝衰竭时大量肝细胞坏死、凋亡,残存的肝细胞不能满足机体需求,导致相关代谢功能紊乱,紊乱的代谢产物在体内堆积对肝细胞造成二次损伤,即“二次打击”学说,这被认为是肝衰竭发生发展的重要机制之一[1-2]。高氨血症是肝衰竭最常见的代谢紊乱[3]。我们前期的研究[4-6]结果表明,血氨升高可以诱导细胞凋亡而致肝细胞损伤,对肝细胞造成“二次打击”,但机制尚不完全清楚,因此迫切需要新的策略进行机制研究,从而为治疗奠定理论基础。
长链非编码RNA (long non-coding RNA,LncRNA)长度通常超过200个核苷酸,无蛋白编码能力。越来越多的证据[7-8]表明,LncRNA参与了许多重要的生物学过程,其表达失调已被证明与许多人类疾病相关。我们应用人凋亡通路LncPathTM芯片筛选出高氨诱导肝细胞中的差异表达LncRNA,通过GO和KEGG通路分析预测这些差异表达LncRNA的生物学作用和涉及的信号通路,并对LncRNA及与其相关的mRNA进行整合分析,探究差异表达LncRNA在高氨诱导肝细胞凋亡中的作用。
1 材料与方法
1.1 细胞来源及分组人正常肝细胞LO2购自中国科学院细胞库(上海)。胎牛血清、RPMI 1640培养基购自美国Hyclone公司。氯化铵购自上海生工生物工程有限公司。细胞用含青/链霉素、体积分数10%胎牛血清的RPMI 1640培养基,在37 ℃、体积分数5%CO2培养箱中常规培养。然后将细胞分为3组:对照组按上述方法常规培养;……
