杨 倩，张 鹏，李 宇，王景林，朱莉益，叶丽敏

贵州省人民医院消化内科，贵州 贵阳 550002

经典Wnt/β-catenin通路的主要组成部分包括19种Wnt蛋白，包括Wnt1、Wnt2、Wnt2b、Wnt3、Wnt3a、Wnt4、Wnt5a、Wnt5b、Wnt7a、Wnt7b、Wnt8a、Wnt8b、Wnt9a、Wnt9b、Wnt10a、Wnt10b、Wnt11、Wnt13(Wnt2b)及Wnt16[1]。Wnt家族基因在哺乳动物中首次被发现是因为Wnt1过表达导致小鼠乳腺肿瘤发生[2]。而在结直肠癌中普遍发现大肠腺瘤性息肉(adenomatous polyposis coli，APC))基因发生截短突变，APC的突变使连环蛋白(β-catenin)稳定表达从而促进肿瘤发生发展[3]。Wnt信号在人类癌症中的广泛作用凸显了靶向该信号通路治疗癌症的重要性和可行性[4-7]。然而，异常活化的Wnt信号通路如何在癌症发展的多个方面起作用尚不清楚。本文将通过生物信息学方法探讨Wnt家族基因在各实体肿瘤中的表达并对Wnt基因变异及其与肿瘤免疫细胞浸润相关性进行分析，为针对Wnt通路在肿瘤尤其是肠道肿瘤中的研究提供一定的理论依据。

1 材料与方法

1.1 Wnt家族基因在各实体瘤中的表达分析Oncomine[8](https://www.oncomine.org/)是目前最大的癌基因芯片数据库及整合数据挖掘平台，可以查找癌症中差异表达的基因。设置筛选条件：阈值(P值)：1E-4,差异倍数：2，基因排序：前10%；数据类型：所有肿瘤。

1.2 Wnt家族基因表达验证UALCAN[9](http://ualcan.path.uab.edu/index.html)是一个全面的、交互式的在线资源，数据来源于TCGA3级RNA-seq和31种癌症类型，可作为验证靶基因和识别肿瘤亚组特异性生物标志物的平台。筛选设置：肿瘤数据来源“TCGA分析”，“基因名”，“TCGA数据集”，“结直肠癌”。

1.3 基因变异情况分析利用cBioPortal(https://www.cbioportal.org/)对目的基因进行变异分析，筛选条件：选择研究进行可视化和分析：TCGA-结直肠癌,泛癌症，526个样本；基因变异分析：选择基因组数据：“GISTIC来源的具有基因突变及假定拷贝数变异的样本”。……