乳腺癌相关非编码RNA 的生物信息学分析

2021-09-02赵林林蒲婷钱婧雯沈红兰周学

生物化工 2021年4期

赵林林，蒲婷，钱婧雯，沈红兰，周学

（南京师范大学泰州学院化学与生物工程学院，江苏泰州 225300）

非编码RNA（ncRNA）是一类不编码蛋白质的RNA 统称，包括微小RNA（miRNA）和长链非编码RNA（LncRNA）。研究乳腺癌相关非编码RNA 的特征并预测其功能，对揭示ncRNA 在乳腺癌中的机制非常重要，也为临床诊疗提供新依据[1-5]。

miRNA 是一类长度约为22 nt 内源性非编码小分子RNA，miRNA 调控人类30%左右的基因。近年来，越来越多的研究显示miRNA 在包括乳腺癌在内的多种恶性肿瘤组织中均存在异常表达[2]。在某miRNA 发生突变后，可能会导致相应癌基因的表达，也可能会出现抑癌基因的缺失，从而使正常机体发生病变。已有研究结果表明，miRNA 可能不仅有助于乳腺癌的诊断、预后以及治疗效果的预测，也有望成为新的治疗靶标[6-10]。

LncRNA 是非编码RNA 中另外一个重要的成员，长度大于200 nt，缺乏开放的阅读框，没有编码蛋白质的功能，其分子内部具有特定而复杂的二级空间结构，它可以提供多个蛋白质结合位点，或通过碱基互补配对原理与DNA 和RNA 特异、动态地相互作用，形成由LncRNA 参与的复杂、精确、精细的基因表达调控网络[2]。LncRNA 具有5'端帽子结构和3'端聚腺苷酸尾巴，基因结构类似于mRNA，LncRNA 和miRNA 可相互作用，又可竞争结合mRNAs。在乳腺癌的发生发展过程中，LncRNA 起到了调节增殖、细胞表型等作用，一些特异性LncRNA 可作为乳腺癌发生发展的标志物[11-13]。

本文通过生物信息学方法研究乳腺癌相关ncRNA的特征并预测其功能，对揭示ncRNA 在乳腺癌中的机制非常重要，也为临床诊疗提供新依据[14-15]。