基于网络药理学探讨十枣汤治疗肝硬化腹水的作用机制
2021-08-24王艳萍李文静
中国医药导报 2021年19期
关键词:数据库
王艳萍 李文静 洪 博
齐齐哈尔医学院药学院,黑龙江齐齐哈尔 161006
肝硬化是功能性肝结构被非功能性纤维化组织逐渐替代为特征的终末期肝脏紊乱[1]。腹水是肝硬化最常见的并发症,腹水的出现是肝硬化患者不良预后的一个标志,3 年病死率高达50%[2]。因此,提高肝硬化患者的生活质量,减少肝硬化腹水(简称“肝腹水”)的并发症及病死率变得越来越重要。
肝腹水相当于中医“膨胀”“单腹胀”范畴。对于肝腹水的治疗,中医多采用“利水”“逐水”等方法。十枣汤由甘遂、芫花、大戟和大枣组成,是峻下逐水的代表性方剂[3]。近年来,研究发现十枣汤在临床上多用于治疗腹水[4-5],但对十枣汤抗肝腹水的作用机制少有研究。
1 材料与方法
1.1 十枣汤中化合物的收集
通过TCMSP 数据库[6]检索十枣汤活性成分。
1.2 活性化合物与靶点筛选
通过口服生物利用度(oral bioavailability,OB),≥30%药物相似性(drug likeness,DL)≥0.18[7-8]对十枣汤中化合物进行筛选并得到靶点。UniProt 数据库对得到的靶点进行基因名转换。
1.3 肝腹水作用靶点筛选
以“liver cirrhosis”为关键词在GeneCards[9]数据库进行检索,根据疾病与靶点间的相关度进行筛选,选出相关靶点。
1.4 蛋白质-蛋白质相互作用网络(protein-protein interaction,PPI)的构建
利用Venny 2.1 在线软件作图工具平台对十枣汤成分靶点与疾病靶点取交集,得到十枣汤抗-肝腹水交集靶点。将其导入String 数据库,构建PPI 网络。
1.5 基因富集通路可视化分析
将药物-疾病靶点导入Metascape 数据库,进行GO 与KEGG 通路富集分析,在微生信在线作图平台进行可视化。
1.6 药物-化合物-靶点-通路网络构建
将药物、化合物、十枣汤-疾病靶点及KEGG 信号通路导入Cytoscape 3.8.0 中,构建药物-化合物-靶点-通路网络。……
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