基于高通量测序的草莓白粉病病原菌分析
2021-08-23张振荣田云霞董琼娥谭海燕张丽芳冯德党赖泳红杨俊誉苏代发崔晓龙童江云
西南农业学报 2021年7期
张振荣,田云霞,董琼娥,谭海燕,张丽芳,冯德党,赖泳红,杨俊誉,苏代发,崔晓龙*,童江云*
(1.昆明市农业科学研究院,云南 昆明 650034;2.云南大学生命科学学院/云南省微生物研究所,云南 昆明 650091)
【研究意义】草莓白粉病严重影响草莓产业的发展,造成极大的生产和经济损失[1],为了研究草莓白粉病病原菌种类和寄生特性,通过高通量测序技术,分析白粉病病原菌种类,研究不同时期病原菌种类的变化,刚离体和离体一段时间后感病组织的微生物群落变化,分析草莓白粉病病原菌多样性情况,了解病害发生特点,对防治草莓白粉病有参考价值。【前人研究进展】目前,草莓白粉病病原菌的人工分离纯培养还没有实现,对草莓白粉病病原菌的鉴定主要依靠病原菌分生孢子、子囊果、附属丝等显微形态的观察[2],鲜有用高通量测序技术或ITS基因测序鉴定草莓白粉病病原菌的报道。【本研究切入点】利用Illumina MiSeq高通量测序平台,对云南省昆明市3个主要栽培种冬草莓的白粉病病原菌进行真菌多样性分析,并将离体白粉病样品在灭菌培养皿内培养7 d,检测长出的真菌群落组成,对比病原菌群落变化,了解病原菌离体后的寄生特性。【拟解决的关键问题】明确昆明地区草莓白粉病病原菌种类和寄生特性,为进一步研究草莓白粉病提供理论依据。
1 材料与方法
1.1 实验仪器与试剂
实验所用DNA 抽提试剂盒(FastDNA®Spin kit for Soil)从MP Biomedicals生物医学公司处购买;GeneJET 胶回收试剂盒从Thermofisher公司处购买。由上海美吉生物医药科技有限公司提供MiSeq PE 300 高通量测序系统并进行测序和相关操作。……
登录APP查看全文
