杜仲U-box基因家族鉴定及分析
2021-08-19赵德刚
赵 丹, 李 波, 赵德刚,2
(1.贵州大学农业生物工程研究院/生命科学学院,山地植物资源保护与保护种质创新教育部重点实验室, 贵阳 550025;2.贵州省农业科学院,贵州省植物保育技术应用工程研究中心, 贵阳 550006)
泛素化是蛋白质组中最常见的翻译后修饰之一,是细胞内短寿命蛋白和一些异常蛋白降解的普遍途径。其中E 3连接酶在泛素化过程中主要负责对靶蛋白的特异性识别,介导26 S蛋白酶体系统对靶蛋白进行泛素化修饰[1],该酶决定着靶蛋白的多样性与特异性。研究表明,含有U-box 蛋白结构域的泛素连接酶E 3在植物的生长发育过程中起着重要作用[2],其U-box 保守域含有约70个氨基酸,U-box 结构域在酵母、植物和动物等真核生物中高度保守。
目前,已经利用基因组数据库对多种植物U-box基因家族进行了鉴定和分析,其中拟南芥(Arabidopsisthaliana)中鉴定到64个U-box 蛋白[3],水稻(OryzasativaL.)中鉴定到77个U-box蛋白[4],蒺藜苜蓿(Medicagotruncatula)中鉴定到41个U-box蛋白[5],大豆(Glycinemax(L.)Merr.)中鉴定到43个U-box 蛋白[6],葡萄(VitisviniferaL.)中鉴定到31个U-box蛋白[7],香蕉(Musaacuminata)中鉴定到91个U-box蛋白[8],甘蓝(brassicaoleraceaL.)中鉴定到99个U-box蛋白[9],苹果中鉴定到69个U-box蛋白[10],番茄中鉴定到62个U-box蛋白[11]。许多U-box蛋白在植物生长发育以及非生物胁迫中发挥着重要作用[12]。
杜仲(EucommiaulmoidesOliv.)是我国特有的国家战略资源树种,既是世界上极具开发潜力的天然橡胶资源,又是我国特有的名贵药材和木本油料树种[13]。杜仲基因组测序的完成,为杜仲基因家族的鉴定提供了数据来源。到目前为止,对杜仲U-box基因家族的研究尚未取得突破进展。U-box基因可能在杜仲的生长发育中起着重要作用,因此对杜仲U-box基因家族的研究具有重要意义。……
