基于PPIN的都匀毛尖根茎叶分析
2021-08-19张龙芬郭治友崔宝禄
王 芬, 张龙芬, 木 仁, 马 媛, 郭治友, 崔宝禄, 李 静, 张 雯
(1.黔南民族师范学院生物科学与农学院, 贵州 都匀 558000;2.长顺县农业农村局, 贵州 长顺 550700)
茶产业是“一带一路”国家战略中的传统优势特色外向型产业,发展前景广阔。茶树是世界上最受欢迎的非酒精饮料作物之一[1],也是非常重要的商业化饮料作物[2];茶树是中国西南地区的特有种,目前种植在40多个国家[3-4]。贵州特有的喀斯特地貌气候呈立体结构,年均降水量1 500 mm,适宜的温度孕育了丰富多样的茶树资源[5],是茶树的发源地及茶叶经济的故乡[6]。截止2016年,贵州的茶叶种植面积达到4.4×105hm2,是茶叶种植面积最大的省份[7],主要品种为福鼎大白茶,具有繁殖力强、产量高、品质好、适应性广的特性。茶叶的流行不仅仅是因为特殊的风味,更是由于主要的次生代谢产物——茶多酚[9-10]。它对人体有益[11],可以抗菌[12],抗肿瘤,具有抗氧化活性[13-15],对心血管疾病、肥胖、糖尿病和代谢综合征都有疗效[16-17]。
蛋白质相互作用网络[18]是指一个物种内的所有蛋白质之间的相互作用关系,并从信号转导、生化等角度进行研究。揭示蛋白质相互作用关系,构建蛋白质相互作用网络图,已成为蛋白组学[19]研究的热点,也是后基因组时代的难题所在。蛋白质相互作用是生物体进行代谢活动的基础,因此,在所有生命活动中,都有蛋白质相互作用现象的发生。研究都匀毛尖的蛋白质相互作用网络可以对茶的整个生物过程有一个综合的理解。
以贵州省黔南州喀斯特山区优势茶叶品种福鼎大白种茶为材料,利用二代Illumina测序平台对其进行转录组测序,分析根茎叶的差异基因,构建差异基因蛋白质相互作用网络。……
