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贵州仡佬族和苗族人群30个插入/缺失位点遗传多态性分析*

2021-08-13刘亚举石美森李学博

检验医学与临床 2021年15期
关键词:贵州

刘亚举,胡 萌,石美森,李学博

1.河南省许昌市公安局刑事科学技术研究所,河南许昌 461000;2.铁道警察学院公安技术系,河南郑州 450053;3.中国政法大学刑事司法学院侦查学研究所,北京100192;4.山东省高校证据鉴识重点实验室(山东政法学院),山东济南 250014

插入/缺失(InDel)多态性遗传标记是指基因组中插入或缺失不同大小的DNA片段所形成的多态性遗传标记。InDel在人类基因组中分布广泛,一般平均每隔7.2 kb就会有一个InDel位点,即约20%的DNA多态性是InDel,在法医学应用领域中,由于InDel具有突变率相对较低、扩增片段较小(通常<200 bp)的特点,适用于降解检材的分析和亲缘关系鉴定,同时InDel是二等位基因,不适合用于混合检材的分析,但其兼具了短串联重复序列(STR)和单核苷酸多态性(SNP)两种遗传标记的双重优点,且可以用法医DNA实验室的毛细管电泳平台进行基因分型检测,分型方法简便、快速、准确,易于在法医DNA实验室进行推广和应用。本研究针对贵州仡佬族和苗族人群常染色体上30个InDel位点的遗传多态性进行分析,评估其在法医学中的应用价值,同时为个体识别和亲权鉴定、群体间遗传分布等相关研究提供参考数据。

1 材料与方法

1.1材料来源 根据知情同意原则,从健康体检人群中随机采集贵州仡佬族(220例,其中男175例、女45例)和苗族(207例,其中男157例、女50例)无血缘关系个体外周血0.1 mL,滴入采血卡(武汉骥腾公司),阴干后常温保存。本研究得到相关道德伦理委员会批准。

通过中国知网(www.cnki.net)和NCBI(www.ncbi.nlm.nih.gov)数据库获得5个汉族[北京汉族(210例)、河南汉族(293例)、上海汉族(565例)、成都汉族(129例)、广东汉族(300例)]和13个少数民族[新疆维吾尔族(223例)、西藏藏族(226例)、福建畲族(119例)、四川彝族(54例)、广西壮族(49例)、广西侗族(50例)、广西苗族(50例)、四川藏族(136例)、云南彝族(122例)、新疆锡伯族(223例)、湖北土家族(236例)、新疆哈萨克族(96例)、云南白族(125例)]等18个人群的30个InDel位点等位基因频率作为群体遗传关系比较的数据。

1.2仪器与试剂 Hamilton STAR-LET自动化工作站(AusBio公司,瑞士);平板离心机(Eppendorf公司,德国);9700型PCR扩增仪(AB公司,美国);3500XL型遗传分析仪和ID-X分析软件(AB公司,美国);GeneMarker®HID分析软件(SoftGenetics公司,美国);Investigator®DIPplex试剂盒(Qiagen公司,德国)。

1.3方法 采用5% Chelex-100快速提取法提取标本DNA。……

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