新疆两个地方绵羊品种策勒黑羊、吐鲁番黑羊的基因组选择信号分析
2021-08-10张小洪刘玲玲马海玉蒋芳芳刘武军
王 琼,曹 行,张小洪,刘玲玲,马海玉,蒋芳芳,刘武军*
(1.新疆农业大学动物科学学院,乌鲁木齐 830052;2.新疆吐鲁番职业技术学院,新疆 吐鲁番 838000)
近年来,在绵羊遗传育种中,选择信号的检测成为鉴定影响重要经济性状潜在作用基因和决定表型变异相关功能基因的重大策略[1]。Moradi等[2]利用绵羊商业化的50K SNP芯片对伊朗两个脂尾和瘦尾不同尾型绵羊品种,采用Fst(Fixation index,群体分化指数)方法进行了群体间选择信号检测,结合单倍型分析结果在脂尾绵羊5号、7号和X染色体上发现了与脂肪沉积相关的基因组选择区域,而且在这些区段内鉴定到与脂肪代谢相关基因NPR2、PPP2CA。Kijas等[3]也利用Fst方法对74个品种的绵羊全基因组进行了选择信号检测,结果发现了控制羊毛色的基因ASIP与绵羊角型相关的基因RXFP2和与骨骼肌发育相关的基因BMP2。2015年Wang等[4]也利用绵羊商业化的50K SNP芯片对三个肉用绵羊品种[3]蒙古羊、德国美利奴羊、杜泊羊用di[4]方法对其全基因组进行了选择信号检测,结果发现了与绵羊肉质性状相关的基因ALDOA、STK32B和FAM190A,与繁殖性状相关的基因CCNB2和SLC8A3。Caiye等[5]用Fst和iHS(integrated haplotype score,综合单倍型评分)方法对三个肉用绵羊苏尼特羊、德国美利奴羊、杜泊羊X染色体进行了选择信号检测,结果在X染色体上发现了与繁殖性状相关的BMP15基因,与免疫相关的VSIG4和PCDH11X基因,与神经系统和皮肤相关的基因PCDH19。
新疆由于地域广阔、气候生态环境多样,在长期自然选择、人工选育过程中形成了丰富且各具特色的绵羊种质资源。在新疆地方绵羊品种中,策勒黑羊的繁殖性能突出,为短瘦尾;……
