等边浅蛤线粒体全基因组测序和系统发育研究
2021-08-05夏立萍郭宝英叶莹莹
夏立萍,徐 鸣,郭宝英,叶莹莹
(国家海洋设施养殖工程技术研究中心,浙江舟山 316022)
线粒体基因组(mitochondrial genome)是一种序列长度相对较短,基因信息丰富且易于分离的DNA 分子。具有母系遗传、进化速率快、包含大量同源基因等特点,且广泛存在于真核生物细胞中,因而成为基因组测序的优先目标被广泛应用于系统发育研究中[1]。绝大多数动物线粒体基因组是共价闭合的双链DNA分子,分子量较小,一般介于14~19 kb 之间,基于G+T%碱基含量来区分DNA 双链重轻链。无脊椎动物线粒体基因组通常包括13 个蛋白质编码基因,22 个tRNA 基因和2 个rRNA 基因以及控制基因复制和转录的控制区[2-3]。少数种类在基因组成上存在变化:如太平洋牡蛎Crassostrea gigas 线粒体基因组中存在3 个rRNA 基因(2 个12S rRNA 基因);绣球海葵Metridium senile 的线粒体基因组中只有2 个tRNA 基因[4];双壳纲贝类一些物种线粒体基因组缺失了ATP8 基因,如文蛤Meretrix meretrix,短文蛤M.petechialis 等[5]。
等边浅蛤Macridiscus multifarious(Kong,Matuskuma &Lutaenko,2012)隶属于软体动物门Mollusca,双壳纲Bivalvia,帘蛤目Veneroida,帘蛤科Veneridae,浅蛤属Macridiscus。等边浅蛤分布于日本、朝鲜、越南、印度尼西亚和印度等地,在我国北起辽宁,南至海南均有分布,常栖息在潮间带中潮区、低潮区至浅海的砂质海底,尤以低潮区最为常见[6]。壳长在1~5 cm 之间,壳高在8 mm~4 cm 之间[7]。因其味道鲜美及丰富的营养而成为中国海岸线养殖中重要的双壳类动物之一。目前浅蛤属中有3 个物种,分别是等边浅蛤、黑浅蛤M.melanaegis (Römer,1860)、半布目浅蛤M.donacinus (Koch,1843)。浅蛤属物种的分类地位在历史上经历了多次变革,包括学名也有较大的争议。Macridiscus 最初在1902 年由DALL 提出,并将其归为花……
