用Biolog-ECO板分析动物笼舍环境微生物
2021-08-03王兴金萨家祺李冠惠黎绘宏成世清
王兴金 萨家祺 李冠惠 黎绘宏 成世清
(广州动物园,广州市野生动物研究中心,广州,510070)
动物的生活环境,包括微生物环境,与动物健康的关系非常密切,不仅因为致病微生物危害动物健康,环境微生物群落还可能通过影响动物肠道菌群而对动物健康产生间接影响。研究表明,圈养和野生大熊猫(Ailuropodamelanoleuca)肠道微生物群落存在一定差异,与其栖息环境、食物资源、活动节律等的影响密切相关[1]。为探讨动物笼舍环境微生物,分别从广州动物园灵长类(Primates)、爬行类(Reptilia)动物笼舍收集了15个环境样本,并采用Biolog-Eco方法进行分析,以期了解动物园动物笼舍环境微生物活性及其影响因素,为更好地养护野生动物提供参考。
1 材料与方法
1.1 样品及处理
样本采集和处理:在动物笼舍的四周及中央部位无菌采集5处垫材样本,共约10 g,按m(样本)∶V(灭菌蒸馏水)=1 g∶9 mL的比例处理样品后,置恒温振荡箱中,4℃振荡1 h,取上清液用灭菌蒸馏水稀释10倍后接种ECO板,150 μL/孔,37℃培养,每24 h分别读取OD590和OD750值。样本来源见表1。

表1 动物笼舍垫材样本来源
1.2 数据分析
微生物代谢活性用平均颜色变化率(average well color development,AWCD,量符号为DAWC)表示,其计算方法为:
DAWC=∑(C-R)/n
式中:C为每个碳源孔在590 nm下的吸光度值减去750 nm下的吸光度值;R为对照孔的吸光度值;n为培养基碳源种类数。当C-R的数值小于0.06时矫正为0处理[2-3]。
对得到的AWCD数据分别采用SPSS 17.0进行方差分析、vegan v2.5-6进行主成分分析、flashClust v1.01-2进行聚类分析。
2 结果与分析
2.1 各样本对ECO板碳源的利用情况
AWCD值反映了样本中微生物的代谢活性,即对碳源的利用能力。……
