王继卿，郝志云，沈继源，柯娜，黄兆春，梁维炜，罗玉柱，胡江，刘秀，李少斌

小尾寒羊泌乳性状重要lncRNAs的筛选、鉴定及功能分析

王继卿，郝志云，沈继源，柯娜，黄兆春，梁维炜，罗玉柱，胡江，刘秀，李少斌

甘肃农业大学动物科学技术学院/甘肃省草食动物生物技术重点实验室/甘肃省牛羊基因改良工程实验室，兰州 730070

【】长链非编码RNA（long non-coding RNAs，lncRNAs）是一类长度大于200nt的非编码RNA分子，它对奶牛和奶山羊的乳腺发育和泌乳过程发挥了重要调控作用，然而在绵羊上研究甚少。为此开展lncRNAs对绵羊泌乳性能的调控作用研究，为解析绵羊泌乳性能的分子机理提供理论基础。选取高泌乳性能（高泌乳量、高乳脂率）和低泌乳性能（低泌乳量、低乳脂率）小尾寒羊各3只，采集泌乳期乳腺组织，用RNA-Seq构建lncRNAs表达谱，研究差异表达lncRNAs靶基因的GO和KEGG富集通路，最后用实时荧光定量PCR（reverse transcription-quantitative PCR, RT-qPCR）对16个差异表达lncRNAs进行验证。在小尾寒羊乳腺组织中共鉴定出7 239个表达的lncRNAs，包括2 262个已知lncRNAs和4 977个新的lncRNAs，大部分lncRNAs呈低丰度表达。在两组小尾寒羊中发现120个差异表达lncRNAs，其中68个lncRNAs在高泌乳性能小尾寒羊中上调表达，52个lncRNAs下调表达。差异表达lncRNAs的靶基因显著富集在硫化物代谢过程、硫酯生物合成过程、酰基辅酶A生物合成过程、Rap1信号通路、粘附连接等通路上。LncRNA-miRNA网络分析发现，MSTRG.125242.6、MSTRG.59580.8等6个最显著差异表达lncRNAs的靶向miRNAs海绵体在家畜乳腺发育和泌乳过程中发挥了重要作用。RT-qPCR结果表明，16个lncRNAs的表达趋势与RNA-Seq结果完全吻合，证实了RNA-Seq测序结果的准确性和真实性。筛选的差异表达lncRNAs参与了绵羊乳腺发育及泌乳性能的调控，该结果将为解析绵羊泌乳性状的分子遗传机制提供理论参考。……