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菜豆CACTA转座元件注释、标记开发及其在品种鉴定中的应用

2021-07-28翟小杰李阳程静徐照龙刘大亮袁娜李英杜建厂

南京农业大学学报 2021年4期

翟小杰,李阳,程静,徐照龙,刘大亮,袁娜,李英,杜建厂*

(1.南京农业大学园艺学院/作物遗传与种质创新国家重点实验室,江苏 南京 210095;2.江苏省农业科学院种质资源与生物技术研究所/江苏省农业生物学重点实验室,江苏 南京 210014)

菜豆(Phaseolusvulgaris)是世界上种植面积最大的食用豆类[1-3]。它具有丰富的食用纤维、矿物质营养元素、维生素和植物营养素,是最有营养价值的蔬菜种类之一[4]。我国菜豆种植历史悠久,种质资源丰富,最早于15世纪从欧洲引入,现在主要分布在黑龙江、吉林、云南、贵州、山西、内蒙古等地区[5-6]。

通常采用形态性状对菜豆种质资源进行鉴定,如栾非时等[7]使用形态学标记对60份菜豆种质资源进行测定;代程等[8]对129份云南蔓生型普通菜豆种质资源进行性状分析。形态学标记方法虽然具有直观和测定简单等优势,但其准确性往往会受到外部因素的影响[9-10]。分子标记技术可以直观反映生物的遗传多样性[11-12]。张赤红等[13]基于SSR标记技术,将377份菜豆种质资源分为6组;颜廷进等[10]利用SNP标记技术对200份国内外菜豆品种进行区分,成功区分出198份种质;分子标记技术在其他园艺作物亲缘关系和系统分类研究中也有着广泛的应用[14-15]。尽管分子标记技术具有简单、实用的优势,但在实际应用过程中,也存在一些不足,如SSR标记技术往往出现通量低和数据整合困难等缺点;而SNP标记研究成本和研究技术要求较高。因此,适当开发新的分子标记,并将其进行实际运用,具有一定的必要性和紧迫性。……

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