蒋 明，王军峰，朱 晏，黄雯馨，应梦豪，马佳莹，戴晨宇

射干叶绿体基因组结构、序列特征与系统发育分析

蒋 明1，王军峰2，朱 晏1，黄雯馨1，应梦豪1，马佳莹1，戴晨宇1

1. 台州学院生命科学学院，浙江 台州 318000 2. 华东药用植物园科研管理中心，浙江 丽水 323000

以射干为材料，在测序、组装获得叶绿体基因组的基础上，明确其结构、序列特征及系统发育关系。利用PE150双末端策略进行建库测序，用NOVOPlasty组装完整的叶绿体基因组，经PCR验证边界，借助生物信息学工具进行序列分析和系统发育研究。射干的叶绿体基因组全长为153 816 bp，大单拷贝区、反向重复区和小单拷贝区的长度分别为83 143、26 214、18 245 bp。射干叶绿体基因组共有133个基因，编码基因、tRNA和rRNA的数量分别为92、38和8；有2个拷贝，其中一个为假基因。系统发育分析结果表明，7种植物叶绿体基因组在发育树上可分为4组，射干与同为鸢尾科的溪荪聚为一组，支持率达100%。射干叶绿体基因组的组装、序列分析和系统发育分析，为该药用植物的遗传结构和遗传多样性研究奠定了基础。

射干；叶绿体基因组；结构；序列分析；鸢尾科

射干(L.) Redouté为鸢尾科（Iridaceae）射干属多年生草本植物，具结节状的根状茎，叶片剑形，花橙红色，花瓣上散生紫褐色斑点，分布于我国的吉林、山东、安徽、江苏、浙江和福建等20多个省份[1]。射干分布广泛，是一种十分常见的药用植物，有着悠久的栽培和药用历史；射干的主要药用部位为其根状茎，它富含酚类化合物，尤其是类黄酮和异黄酮类物质，如射干苷、白射干素、鸢尾黄素和野鸢尾苷等[2]。……