史海龙，史永恒，王 川，程 怡，黄 月，刘继平，王 斌

基于计算机模拟技术以埃博拉病毒跨膜糖蛋白为靶点挖掘中药抗病毒活性分子

史海龙，史永恒，王 川，程 怡，黄 月，刘继平，王 斌*

陕西中医药大学，陕西 咸阳 712046

基于埃博拉病毒跨膜糖蛋白（transmembrane glycoprotein of the Ebola virus，EBOV-GP）的三维空间结构，运用计算机虚拟筛选技术从中国台湾中医药数据库TCM@TAIWAN中寻找具有抗病毒作用的中药活性分子。以EBOV-GP为靶点，采用类药性评估、分子对接、分子动力学模拟以及吸收、分布、代谢和排泄（absorption、distribution、metabolism and excretion，ADME）预测等多尺度虚拟筛选策略，从TCM@TAIWAN数据库中挖掘候选药效分子，并分析候选分子与靶点的相互作用情况。以胺碘酮为阳性对照药物，筛选出4个类药性良好的中药单体ZINC85531496、ZINC85567560、ZINC85592968、ZINC33833122，与EBOV-GP亲和力及相互作用基团均优于胺碘酮。采用多种计算机虚拟筛选技术挖掘EBOV-GP抑制剂，可促进从天然产物化学结构数据库中提取、设计以及实验合成抗埃博拉病毒的药效分子。

埃博拉病毒；跨膜糖蛋白；虚拟筛选；中药；抗病毒活性分子

埃博拉病毒是一种致病性致病菌，可以引起人类和动物出血热，并在感染后7～11 d导致90%病例死亡。目前很多药物和疫苗尚处于研发或临床试验阶段，因此迫切需要研发安全性高、耐药性好的抗病毒药物[1]。

埃博拉病毒带有1个负义RNA基因组，包含7个编码不同结构蛋白的基​​因，分别为、、、、糖蛋白、核蛋白和聚合酶。埃博拉病毒跨膜糖蛋白（transmembrane glycoprotein of the Ebola virus，EBOV-GP）是病毒体表面上唯一在病毒中表达的蛋白，对于附着于宿主细胞和催化膜融合至关重要。因此，EBOV-GP是疫苗的关键组成部分，也是中和抗体以及附着和融合抑制剂的靶点。……