桃品种鉴定的SSR 核心引物筛选及其应用*
2021-06-27关利平王玲玲王力荣
关利平,王玲玲,曹 珂,王力荣
(中国农业科学院郑州果树研究所,河南 450009)
我国是桃属植物的起源中心,种质资源非常丰富。桃在我国有近5 000 年的栽培历史,各地交流频繁,大多数品种差异不甚明显,造成同物异名、同名异物现象时常发生[1]。因此,迫切需要建立一套快速、准确的桃品种鉴定技术体系,为桃知识产权保护提供技术支撑,这对桃种质资源保存、开发利用及提高育种效率等具有重要的理论意义和应用价值。国际植物新品种保护联盟(UPOV)推荐SSR(simple sequence repeat)和SNP(single nucleotide polymorphism)作为指纹图谱构建的标记方法。其中,SSR 标记由于技术成熟、多态性高、稳定性强及成本低等特点,已对苹果[2]、梨[3]、枣[4]等物种的全基因组SSR 进行了全面的解析。
目前,国内外的学者已经在桃上开展了大量关于SSR 标记开发和指纹图谱构建的研究。如Yoon等[5]从已发表的108 个SSR 位点中筛选出33 个,对96 份桃及油桃进行鉴定;陈昌文等[6]利用BPPCT、UDP 等80 对SSR 引物,对237 份中国桃地方品种、育成品种及其野生近缘种进行鉴定,筛选出8 对引物,使176 份种质具有可分辨的分子身份证;Bouhadida 等[7]筛选出15 对SSR 引物,对94 份桃种质进行扩增,结果表明其中的8 对引物可以有效区分所有种质;Cao 等[8]从桃全基因组上筛选出53 对SSR 引物,对104 份中国桃地方品种进行鉴定;王清明等[9]选用35 对已发表的SSR 引物构建了22 份观赏桃的指纹图谱。虽然上述SSR 标记在桃指纹图谱构建上得到了广泛应用,但按照传统的方法,这些SSR 标记的开发不仅费时、费力、效率低且缺乏统一标准。
随着桃基因组测序完成,使得从全基因组开发SSR 标记成为可能,且基于桃的全基因组重测序数据开发的SSR 标记可能存在更高的多态性。……
