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全基因组测序技术在口岸耐多药肺结核诊断中的应用探索

2021-06-24吴培丰高颖龙谭家辉何洪涛王向阳张建明通讯作者广州国际旅行卫生保健中心广东广州510635

口岸卫生控制 2021年3期
关键词:耐药检测

温 颖 吴 健 吴培丰 高颖龙 陈 平 谭家辉 何洪涛 王向阳 张建明(通讯作者)广州国际旅行卫生保健中心(广东,广州,510635)

赵 卫 谢 茜 赵久波 余健海 覃直然 南方医科大学公卫学院(广东,广州,510515)

耐药结核始终是结核病防控的焦点与难点[1],尤其是耐多药结核(MDR-TB),其传播危害大、传染期长、治疗费用高(是普通肺结核的100倍)、治愈率低(约为50%),是影响结核病防控工作的最重要因素。2019年,全球近50万人患单利福平耐药结核(RR-TB),其中78%的人患MDR-TB[2]。若MDR-TB患者在口岸未能及时准确检出,造成跨境传播[3-4]而至暴发[5],将对我国境内以及境外个人、家庭和国家造成严重的公共卫生负担。因此,我国口岸对传染性肺结核的诊断不应仅局限于临床病原体的鉴定水平,快速、准确且高通量的MDR-TB检测技术,将是未来口岸结核病防控的必要工具。目前经典的药物敏感性检测(DST)耗时长(2-4周),而市场上主流的线性探针技术(LPA)、Xpert等MDR-TB检测技术仅对目前已知的异烟肼(isoniazid,H)和/或利福平(rifampicin,R)的耐药经典位点进行检测,可能出现一定程度的漏检[6],均不适宜未来口岸的防控需求。全基因组测序(WGS)技术可对结核菌株耐药突变位点检测全面覆盖,且具有准确、高通量等优点[6]。本研究应用WGS技术对2008-2018年广州国际旅行卫生保健中心结核生物样本库中的MDR-TB相关菌株进行检测,并综合患者流行病学及治疗情况,探索单末端(SE)50WGS-NDA纳米微球(DNB)技术在口岸MDR-PTB检测方面应用的可行性。

1 材料和方法

1.1 材料收集

本研究收集整理2008-2018年广州国际旅行卫生保健中心结核生物样本库中的结核临床分离耐药菌株(HR、RR、MDR和XDR)92株,按照2∶1比例随机抽取库中敏感菌株46株。……

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