猪流行性腹泻病毒湖南分离株ORF3基因克隆与遗传进化分析
2021-06-17杨雅娣
廖 帆,杨雅娣,谭 磊
(湖南农业大学动物医学院,湖南 长沙 410128)
猪流行性腹泻(Porcine Epidemic Diarrhea,PED)是严重影响我国养猪业发展的肠道传染病,由猪流行性腹泻病毒(Porcine Epidemic Diarrhea Virus,PEDV)引起,该病具有急性和高度接触性等特点[1]。仔猪感染PEDV后可表现严重的临床症状,如呕吐、消瘦和持续性腹泻等,并出现高死亡率。近来年,PED仍然是导致我国仔猪腹泻的主要肠道病原之一,大部分猪场暴发PED由PEDV变异株感染所致,少数则由PEDV传统株感染引起,使得目前我国PED的防控较为严峻[2]。由于发病仔猪在短时间内会出现死亡,对PED进行及时而准确的诊断对该病的防控极为重要,本次研究采用RT-PCR技术对某规模化猪场疑似感染PEDV的仔猪肠道组织进行病原诊断,并对PEDV毒株的ORF3基因序列进行扩增与分析,确定导致仔猪发病的PEDV毒株类型,为相应的防控措施制定提供数据支持。
1 材料与方法
1.1 病料来源
12份样品来源于湖南省某规模化猪场,该场于2018年9月初暴发腹泻,样品均为带有腹泻症状的仔猪肠道组织及其内容物。
1.2 试验材料
Trizol Regent购买于美国赛默飞公司;反转录相关试剂购自于美国Promega公司;PCR试剂及DNA marker分别购自于长沙擎科生物有限公司和北京全式金生物有限公司;其它耗材购自于深圳华大基因股份有限公司;PCR仪购自于美国ABI公司;不同规格移液器和低温冷冻离心机等购自于美国。参考文献[3]合成ORF3基因扩增引物,引物由长沙擎科生物科技有限公司合成。
1.3 样品的处理及组织RNA提取
取1.0 g左右组织样品,剪碎,置于2.0 mL的离心管中,加入适量生理盐水后匀浆,其后反复冻融3次,低温高速(12 000 r/min)离心15 min,取上清液。……
