宏基因组测序技术在儿童中枢神经系统感染性疾病中的临床价值分析
2021-06-11姚仲伟苏淑芬李美锦邹新飞郑爱妮郑亦男
姚仲伟 苏淑芬 李美锦 邹新飞 郑爱妮 郑亦男
广东省妇幼保健院PICU,广州 511400
中枢神经系统(central nervous system,CNS)感染性疾病是儿童时期严重的疾病,常因临床症状不典型、实验室诊断延误导致治疗不及时,病死率高,尤其是细菌性脑膜炎患者的病死率一直居高不下,且存活患者中相当一部分遗留后遗症[1-3]。明确CNS感染的病原体对于降低CNS感染的病死率、缩短住院时间、减少后遗症都有重要的作用。传统的检测方法以脑脊液涂片、细菌培养和抗原检测为主,部分实验室开展分子生物学检测。但这些传统的检测方法总体上阳性率偏低,超过50%的CNS感染性疾病最终都无法明确病原诊断[4-6]。而病原学诊断对CNS感染的诊断及治疗至关重要,故寻找一种在特异性与灵敏度方面均优于传统检测方法的新型检测方法意义重大。
宏基因组测序技术(metagenomic next generation sequencing,mNGS)作为一种快速、低成本和高通量的病原体DNA测序技术,已用于CNS各类病原体感染检测,对比传统检测方法具有高检测效率和准确性[7]。本研究对两组分别行脑脊液常规培养联合荧光定量PCR(qPCR)和mNGS检测的疑似CNS感染患者的相关结果进行分析,以明确mNGS在CNS感染性疾病病原检测方面的优势。
1 资料与方法
1.1 一般资料 收集2019年4月至2020年1月入住本院PICU以发热、抽搐、呕吐、嗜睡等为首发症状,考虑CNS感染性疾病的患儿55例为观察组,收集患儿脑脊液行mNGS检测。选择2018年5月至2019年4月入住本院PICU的疑似CNS感染并进行了脑脊液常规培养和qPCR检测的患儿51例为对照组。qPCR检测病毒指标包括:巨细胞病毒-DNA、EB病毒-DNA、单纯疱疹病毒II型-DNA、单纯疱疹病毒I型-DNA、人肠道病毒-RNA。……
