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单细胞转录组测序在哮喘研究中应用的研究进展

2021-06-07综述吾尼且木吐拉克滕方舟汤蔚峰董竞成审校

复旦学报(医学版) 2021年3期

魏 颖(综述) 吾尼且木·吐拉克 滕方舟 汤蔚峰 董竞成△(审校)

(1复旦大学附属华山医院中西医结合科 上海 200040;2复旦大学中西医结合研究院 上海 200040)

哮喘是一种异质性疾病,转录组测序常用来研究哮喘的发病机制及药物干预哮喘的疗效。由于哮喘的异质性,传统基于血液或组织样本的转录组测序方法获得的是细胞群体的宏观结果,呈现的是同一基因在所有细胞中的平均表达水平,不能呈现同一基因在单个细胞之间存在的差异以及其在疾病发病机制中的作用,因此不能完全揭示异质性哮喘的发病机制及药物疗效。单细胞转录组测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)是在单细胞水平对全转录组进行扩增与测序的一项新技术,能够获得每个细胞的mRNA表达信息,发现不同的细胞亚群以及相关信息,揭示细胞间基因表达的异质性并鉴定稀有细胞类型。scRNA-seq能够绘制肺组织细胞图谱,进行细胞谱系追踪,多角度、多层次和直观认识哮喘的发病机制,为深入研究和理解哮喘发病机制提供新的技术手段。本文对scRNA-seq技术在哮喘研究中的应用做一概述,以期为哮喘这一异质性疾病发病机制的深入研究提供思路。

哮喘概述哮喘影响各年龄段的健康,患病率逐年上升,尤其是儿童患病率。据WHO统计,目前全球约有3亿人罹患哮喘,哮喘在不同国家的患病率为1%~18%,每年因哮喘死亡的人数高达25万,对个人、家庭和社会造成沉重的负担。全球哮喘防治创议(Global Initiative for Asthma,GINA)指出,哮喘是一种异质性疾病,以慢性气道炎症为主要特征[1]。……

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