RNA测序探讨COPD患者外周血单个核细胞环状RNA表达差异

2021-06-03丁毅鹏

海南医学院学报 2021年10期

张君，詹峰，孙娟，丁毅鹏

（1.海南医学院附属海南医院，2.海南省人民医院急诊科，3.海南省人民医院全科医学科，海南海口570311）

慢性阻塞性肺疾病（COPD）是一种常见的气道疾病，其特征是慢性毛细支气管炎和肺气肿［1］，研究表明，COPD由遗传和环境危险因素相互作用引发的肺部炎症所诱发［2］。预计到2020年成为全球慢性发病与死亡的第3大诱因［3］。研究表明，COPD与严重的新型冠状病毒（COVID-19）相关，COPD合并COVID-19患者致死率更高［4］。

环状RNA（circRNA）是一类非编码RNA［5］，与传统的线性RNA相比，它的分子结构呈闭合环状，不含有3′-ployA尾和5′-帽子结构，不易被核酸外切酶降解，比线性RNA更稳定，种类繁多，广泛分布于不同的组织与结构中，数量为线性mRNA的10倍［6，7］。环状RNA主要通过竞争性结合miRNA，实现对miRNA靶基因的调控［8］，也可以通过直接调控基因表达发挥功能［9］。在COPD［10］、心肌梗死［11］、肿瘤［12］等中发挥重要功能。研究表明，CircRNA 0001859可以作为COPD和急性COPD的新诊断和预后生物标志物［13］。COPD相关环状RNA表达网络与可能调控机制的研究目前尚不太了解。

本研究，通过收集5例COPD患者与5名正常人的外周血单个核细胞，进行环状RNA转录组测序，检测并分析COPD外周血单个核细胞环状类型，环状RNA差异表达，环状RNA来源基因的GO（Gene Ontology，基因本体论）功能聚类与环状RNA来源基因的KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes，京都基因与基因组百科全书）信号通路聚类分析。为从环状RNA角度进一步阐述COPD发病机制与环状RNA在COPD中可能的调控机制提供理论依据。