肺腺癌细胞中长链非编码RNA-ARAP1-AS1表达模式及其生物学特征
2021-06-02张欢欢
刘 欣,张欢欢,关 平,邓 瑾
(1.广州市胸科医院检验科,广州 510095;2.广州医科大学附属肿瘤医院放疗科,广州 510095)
肺癌是全球最常见的恶性肿瘤,其发病率及死亡率在各类恶性肿瘤中居于首位[1]。肺腺癌是具有腺样分化或黏液分泌的恶性上皮肿瘤,是肺癌中最常见的病理类型。相关研究指出,肺腺癌患者接受治疗后仍有相当部分发生转移,且患者 5年生存率较低[2-3]。目前,肺腺癌发生发展的机制尚未完全阐明。
长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)是一类长度大于200nt 的非编码RNA。lncRNA 主要在表观遗传、转录及转录后等层面调控基因表达,从而在体内发挥广泛且复杂的生物学作用[4-5]。部分lncRNAs(HOTAIR,H19,ANRIL,MALAT1,MEG3 和GAS5 等)在肺腺癌中的作用已被揭示,但仍有更多的未知lncRNAs 及其作用机制有待进一步的研究[5-10]。
LncRNA ARAP1-AS1 转录本ID 是ENST0000054 2022.1,位于11 号染色体,其转录本全长388 nt,由2 个外显子组成。本研究通过探究ARAP1-AS1在肺腺癌中的表达及其相关生物学特征,初步探讨其在肺腺癌中的作用。
1 材料与方法
1.1 研究对象 收集2017年5月~2018年9月广州医科大学附属肿瘤医院23 对肺腺癌及癌旁正常组织标本。人正常肺上皮细胞BEAS-2B 和人肺腺癌细胞株A549,H1299,H1975 和HCC827 均由课题组自主保存。
1.2 仪器与试剂 PCR 扩增仪购自美国Bio-RAD公司。Lipofectamine 2000 试剂盒及 Trizol 试剂购自美国 Invitrogen 公司。cDNA First Strand Reversing kit 及qRT-PCR SYBR Master Mix 试剂盒购自加拿大Fermentas 公司。多功能酶标仪购自美国Bio TEK 公司。10g/dl 胎牛血清的1640 购自美国Gibco公司。PARISTMKit 试剂盒购自thermofisher 公司。6 孔板、96 孔板购自美国Corning 公司。
1.3 方法
1.3.1 细胞及培养:将人正常肺上皮细胞BEAS-2B 和人肺腺癌细胞株A549,H1299,H1975 和HCC827 接种于含10g/dl 胎牛血清的1 640 培养液中,在37 ℃,5ml/dl CO2培养箱中培养。……
