朱丽萍，张文成，颜世敢*，陈蕾蕾，崔生辉

(1. 齐鲁工业大学生物工程学院/山东省微生物工程重点实验室，山东 济南 250353；2. 山东省农业科学院农产品研究所，山东 济南 250100；3. 中国食品药品检定研究院，北京 100050)

食品安全关系人民健康和国计民生，是全球关注的热点问题。食源性疾病是引发食品安全事件的主要因素。全球每年约15亿人患食源性疾病，其中约70%是因食品被微生物污染所致。我国46.4%的食品安全事件是由食源性致病菌引起。沙门菌、致病性大肠杆菌、李氏杆菌等是最重要的食源性致病菌。其中沙门菌引起的食物中毒在微生物性食物中毒中占比高达70%～80%，每年造成全球约1.15亿人感染和37万人死亡[1]。加强对沙门菌等食源性致病菌的监控和防控，意义重大且迫在眉睫。

细菌分型是细菌溯源、流行病学调查、食品安全监管的重要手段，对食品安全、公共卫生具有决定性意义。

1 细菌溯源分型技术概述

细菌溯源分型技术包括表型分型技术和基因分型技术两类。表型分型技术有血清分型、噬菌体分型等；基因分型技术有脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis，PFGE)、多位点序列分型(multilocus sequence typing，MLST)、核糖体多位点序列分型(ribosome multilocus sequence typing，rMLST)、全基因组单核苷酸多态性(whole genome single nucleotide polymorphism，wgSNP)、全基因组多位点序列分型(whole genome multilocus sequence typing，wgMLST)、核心基因组多位点序列分型(core genome multilocus sequence typing，cgMLST)等。目前常用的细菌溯源分型技术以血清学分型、PFGE、MLST为主。血清学分型依靠肉眼观察血清型试验是否出现凝集而判断细菌的抗原型，试验误差大，分辨率低，再加上细菌的血清型众多，如沙门菌有2 610种血清型[2]，血清学分型的工作量大、耗时长，分型效果不理想。……