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猪瘟病毒微滴式数字PCR方法的建立

2021-05-20高晓龙王英超沈光年刘晓冬周德刚冯小宇

中国动物传染病学报 2021年2期
关键词:检测方法

高晓龙,王英超,李 月,沈光年,刘晓冬,周德刚,梅 力,冯小宇

(1.北京市动物疫病预防控制中心,北京102600;2.北京市兽药监察所,北京102629)

猪瘟(classical swine fever,CSF)是由猪瘟病毒(Classical swine fever virus,CSFV)引起的一种高度接触性传染病。其在家猪和野猪中广泛传播,严重威胁猪养殖业,被世界动物卫生组织(World Organization for Animal Health,OIE)列入OIE疫病名目[1],为必须申报的法定传染病,也是我国农业农村部规定的一类传染病[2]。

近年来,我国猪瘟病毒的感染病例多呈现非典型性临床症状和病理剖检变化,其典型特征与当下我国广泛流行的非洲猪瘟极其相似,表现为发热、全身广泛性小点出血、便秘腹泻、脾梗死等。因此,必须通过实验室诊断进行鉴别。目前已有的检测方法包括ELISA、普通PCR、实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,qPCR)、环介导等温技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)[3]、重组酶扩增酶检测技术(recombinase polymerase amplification,RPA)[4]等,但以上方法均存在灵敏度不够,出现假阳性或假阴性的情况。

数字PCR( digital PCR,dPCR)属于第3代PCR,最早出现于1999年[5],其中微滴式数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)技术是近年来广泛用于标准物质定量的核酸检测技术。与传统的qPCR相比,ddPCR通过统计学原理直接给出浓度,其结果不再依赖于Ct值[6],避免了在低拷贝数、细微模板浓度差异中灵敏度和精确度的缺陷,能够实现绝对定量。Yan等[7]采集了10个感染H7N9的患者不同治疗时期的样本,分别进行qPCR及ddPCR检测,发现对于qPCR阴性的样本,ddPCR仍可以检测出病毒的存在,说明ddPCR的灵敏度远高于qPCR。ddPCR不仅可以对病原体定性,而且还能对病原体DNA或RNA序列进行绝对定量,从而对疾病进行早期诊断、药物疗效观察、病情判断及预后观察,目前dPCR技术已广泛的应用于乙型肝炎病毒(Hepatitis B Virus,HBV)、艾滋病病毒(Human immunodeficiency virus,HIV)、甲型流感病毒等临床领域[8]。……

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