刘维 陆展华 卢东柏 王晓飞 王石光 薛皦 何秀英

水稻小穗簇生基因的定位及候选基因分析

刘维 陆展华 卢东柏 王晓飞 王石光 薛皦 何秀英*

（广东省农业科学院 水稻研究所/广东省水稻育种新技术重点实验室, 广州 510640;*通信联系人, E-mail: xyhe@163.com）

【】通过对水稻小穗簇生基因的定位与候选基因分析，为进一步克隆幼穗发育过程中缩短枝梗长度造成小穗簇生的功能基因奠定基础。以航天诱变育种技术处理常规优质稻品种粤农丝苗获得一个稳定遗传的小穗簇生突变体为试验材料，与粤金银占构建F1、F2作图群体，对簇生基因进行定位，结合转录组测序对候选基因进行预测与评价。遗传分析结果表明，突变体的簇生性状由非完全显性单基因控制，混合分组分析法将该基因定位于第6染色体上约416 kb的区间。进一步通过表达谱分析、转录组测序技术、基因序列差异性分析和qRT-PCR验证等筛选出为最佳候选基因，其5′-UTR区域发生9个碱基的插入突变，暗示该基因可能通过二级结构改变调控转录或翻译水平，参与水稻幼穗发育过程中枝梗的分化。【】本研究结果为解析水稻二次枝梗和小穗梗缩短机制奠定一定理论基础。

航天诱变；小穗簇生；基因定位；转录组测序；候选基因

水稻（L.）不仅是世界上最重要的粮食作物，还是禾本科作物分子生物学研究领域重要的模式植物[1-2]。穗是水稻产量形成的关键部位，穗型是株型的重要组成部分[3-4]。水稻穗的形成过程不仅是植株形态建成中的重要事件，也是决定水稻能否顺利完成正常生殖发育的重要阶段之一，并且穗部结构与水稻产量息息相关[5]。……