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天祝白牦牛与黄牛NGB蛋白三级结构比较分析

2021-05-06米晓钰朱晓林温永强杜晓华

生物信息学 2021年1期
关键词:结构

米晓钰,李 乔,马 睿,朱晓林,温永强,刘 霞*,杜晓华

(1.甘肃农业大学 生命科学技术学院, 兰州 730070;2. 甘肃农业大学 动物医学院,兰州 730070)

脑红蛋白(Neuroglobin,NGB)是德国科学家Burmester于2000年首次发现的一种特异性携氧球蛋白,主要分布于中枢神经系统[1]。与血红蛋白、肌红蛋白相比,NGB具有经典螺旋三折叠结构的特点,其基本结构是蛋白质肽链和 1 个血红蛋白[2]。蛋白质结构是生物长期演化出的结果,从 DNA 编码转录翻译到蛋白质序列折叠形成稳定的空间结构,并非一个随机产生的过程。对任意蛋白质的序列进行修改,即使只增加、删除或修改蛋白质序列中的一个氨基酸,蛋白质结构都会发生明显的改变,相应的蛋白质功能也会随之变化,而如果修改两个及以上氨基酸,多数蛋白将无法进行有效的折叠[3]。要想深入探究蛋白质的内部功能机制,则首先需要证明蛋白质结构与其功能之间的关系。近年来,国内外学者主要对NGB转录调控机制及其在神经元中的保护作用开展了相关研究工作[4-7],至于NGB蛋白结构学方面的研究,则多集中于对其基本结构[8]及功能相关核心位点的研究[9-10],国内目前对于该项工作的研究尚处于生物信息学的初步分析阶段[11],而针对NGB蛋白三级结构的详细预测分析还未见相关报道。本项目组李盛杰等[12]研究发现,天祝白牦牛NGB基因编码的氨基酸序列与普通黄牛相比,在第83、97位分别发生了丝氨酸(Ser)→脯氨酸(Pro)、精氨酸(Arg)→谷氨酰胺(Gln)的突变,但其生物学意义目前尚不明确。……

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