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基于生物信息学筛选染料木素抗骨肉瘤靶基因

2021-05-06郭良煜陈敬腾龚长天施玉博郭卫春

生物信息学 2021年1期
关键词:关键数据库信号

郭良煜,余 铃,陈敬腾,龚长天,施玉博,郭卫春

(武汉大学人民医院 骨科, 武汉 430060)

骨肉瘤(Osteosarcoma,OS)是来源于骨组织的恶性肿瘤,多见于青少年和儿童,发生部位在长骨远端,在早期就容易产生远处转移和侵袭[1-2]。大约15%~20%的患者在早期就诊时可发现转移。肺是最常见的转移部位,占转移疾病的85%以上,而骨骼是远处转移的第二常见部位。近几年来化疗药物的使用虽然提高了骨肉瘤患者的生存率和生活质量,但患者对化疗药物产生的耐药性和较高的毒副作用仍然是难解决的问题[3]。 因此,急需新的药物进行治疗。

染料木素(Genistein)是一种天然存在于水果、坚果和大豆中的物质,前期的许多研究表明了它能有效的抑制乳腺癌、前列腺癌、肝癌、卵巢癌、膀胱癌、胃癌,脑癌以及神经母细胞瘤和慢性淋巴细胞白血病的活性[4]。同时染料木素也能够通过抑制炎症、促进细胞凋亡、调节类固醇激素受体和代谢途径等方面来降低肿瘤细胞的活性和数量[5]。染料木素的抗肿瘤能力在许多癌症中都得等到了体现,但在骨肉瘤的研究中却很少见。

近几年来开始使用生物信息学的方法来筛选药物可能作用的靶基因,在通过靶基因与肿瘤之间的关系来评价药物对肿瘤是否有作用,例如利用生物信息学预测白黎芦醇作用于前列腺癌的靶基因[6];用生物信息学方法来筛选对乳腺癌治疗有用的药物和它们的靶基因[7]。本研究在DrugBank 数据库筛选染料木素作用的靶基因。经过一系列方法筛选出CXCL8,CXCL12,LPAR1和CNR1;……

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