樊晓静，于文涛，蔡春平，林浥，王泽涵，房婉萍，张见明，叶乃兴

利用SNP标记构建茶树品种资源分子身份证

樊晓静1，于文涛2，蔡春平2，林浥1，王泽涵1，房婉萍3，张见明4，叶乃兴1

1福建农林大学园艺学院/茶学福建省高校重点实验室，福州 350002；2福州海关技术中心/福建省检验检疫技术研究重点实验室，福州 350001；3南京农业大学园艺学院，南京 210095；4武夷学院科研处，福建武夷山 354300

【】建立茶树品种的SNP分子标记数据库，结合茶树品种基本信息，将SNP位点组成的DNA指纹图谱构建28位数字组成的茶树品种资源分子身份证，便于茶树品种资源的保护与精准管理，避免“同名异物、同物异名”的现象。通过挖掘茶树的表达序列标签，获得大量的高质量表达序列标签，将其进行装配后，开发候选位点，将候选位点与茶树全基因组进行BLAST，得到其在全基因组染色体上的位置与具体关联基因。以铁观音、福鼎大白茶、龙井43、云抗10号等103份国内外不同类型的茶树品种资源为供试材料，提取基因组DNA，利用预扩增技术和微流体芯片法对供试茶树品种资源进行SNP基因分型，获得SNP位点数据及候选SNP位点的信息指数、观测杂合度、期望杂合度等信息，将多态性从高到低进行排序，进行SNP位点组合筛选，得到最优SNP位点组合后，结合茶树品种基本信息构建茶树品种资源分子身份证。从茶树的表达序列标签数据库中挖掘出1 786个候选SNP位点。根据序列保守性，筛选出96个SNP标记位点，与最新茶树基因组比对发现候选位点较均匀地分布于茶树全基因组的15条染色体上；……