微小RNA介导意大利蜜蜂工蜂对东方蜜蜂微孢子虫的跨界调控
2021-05-07杜宇范小雪蒋海宾王杰冯睿蓉张文德余岢骏隆琦蔡宗兵熊翠玲郑燕珍陈大福付中民徐国钧郭睿
杜宇,范小雪,蒋海宾,王杰,冯睿蓉,张文德,余岢骏,隆琦,蔡宗兵,熊翠玲,郑燕珍,2,陈大福,2,付中民,2,徐国钧,2,郭睿,2
微小RNA介导意大利蜜蜂工蜂对东方蜜蜂微孢子虫的跨界调控
杜宇1,范小雪1,蒋海宾1,王杰1,冯睿蓉1,张文德1,余岢骏1,隆琦1,蔡宗兵1,熊翠玲1,郑燕珍1,2,陈大福1,2,付中民1,2,徐国钧1,2,郭睿1,2
1福建农林大学动物科学学院(蜂学学院),福州 350002;2福建农林大学蜂疗研究所,福州 350002
【】东方蜜蜂微孢子虫()感染意大利蜜蜂(,简称意蜂)导致蜜蜂微孢子虫病。本研究结合前期已获得的miRNA和mRNA组学数据,通过生物信息学方法对意蜂工蜂中肠的差异表达miRNA(differentially expressed miRNA,DEmiRNA)靶向结合的东方蜜蜂微孢子虫的mRNA和差异表达mRNA(DEmRNA)进行预测、数据库注释和调控网络分析,以期在组学水平解析miRNA介导意蜂工蜂对东方蜜蜂微孢子虫的跨界调控机制。通过比较东方蜜蜂微孢子虫侵染7 d和10 d的意蜂工蜂中肠(AmT1、AmT2)和未受侵染的工蜂中肠(AmCK1、AmCK2)的miRNA组学数据筛选出宿主的显著性DEmiRNA,通过比较侵染意蜂工蜂中肠的东方蜜蜂微孢子虫(NcT1、NcT2)和东方蜜蜂微孢子虫纯净孢子(NcCK)的mRNA数据筛选出病原的DEmRNA。利用TargetFinder软件预测宿主显著性DEmiRNA靶向结合的病原mRNA和DEmRNA。利用相关生物信息学工具对上述靶DEmRNA进行GO和KEGG数据库注释。结合前期研究结果筛选出孢壁蛋白、极管蛋白、蓖麻毒素B凝集素、ABC转运蛋白、ATP/ADP移位酶和糖酵解/糖异生途径等毒力因子和能量代谢通路相关的病原DEmRNA及与其存在靶向结合关系的宿主显著性DEmiRNA,并构建和分析二者的调控网络。AmCK1 vs AmT1比较组中宿主的48条显著上调miRNA和36条显著下调miRNA分别靶向病原的1 345和1 046条mRNA;……
