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基于高通量测序技术分析微冻凡纳滨对虾的微生物

2021-04-29陶飞燕陈胜军邓建朝李春生王悦齐

南方水产科学 2021年2期

陶飞燕 ,潘 创,陈胜军,胡 晓,邓建朝,李春生,荣 辉,王悦齐

(1. 上海海洋大学食品学院,上海 201306; 2. 中国水产科学研究院南海水产研究所/农业农村部水产品加工重点实验室/国家水产品加工技术研发中心,广东 广州 510300)

凡纳滨对虾 (Litopenaeus vannamei) 是养殖产量最高的三大虾品种之一[1]。根据《2020中国渔业统计年鉴》[2]数据,凡纳滨对虾产量占海水养殖虾的78.91%和淡水养殖虾的21.29%。其味道鲜美,营养丰富,含人体必需氨基酸及钙 (Ca)、铁 (Fe)、锌 (Zn) 等矿物元素[3],是一种兼具营养价值与经济价值的高蛋白营养水产品,近年来国内外对其需求逐渐上升[4]。然而,对虾在贮藏和流通过程中,品质容易劣变,其表面附着的微生物是造成其变质的最根本因素。受生长环境、加工工艺、产品特征等因素的影响,凡纳滨对虾会形成自身独有的菌相,数量及种类繁多[5-7]。在对虾失去活力后,那些适合生存的微生物会利用虾体内丰富的营养物质进行生长繁殖,产生腐败气味,加速腐败进程,严重影响产品的货架期。因此对凡纳滨对虾进行菌相研究,找出贮藏过程中的优势微生物对控制其品质具有重要意义。

对水产品微生物的研究以往多通过对菌株进行富集培养和分离纯化,再根据形态、生理、生化等实验得出结果,但结果往往不能完全反映样品中微生物种类的真实情况[8]。近年来,随着科技的进步,以DNA为基础的宏基因组学技术取得较大进展。以高通量测序为主的宏基因组学技术是一种非培养分析法,无需对菌株进行培养,而是直接从样品中提取出细菌的总DNA进行分析,能检测到难以培养或不能培养的微生物[9]。……

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