甲状腺乳头状癌中SKA3蛋白的表达及其与预后、免疫细胞浸润的关系
2021-04-25杜春平莫颖禧曾丽霞陈肖瑜罗文奇
杜春平,莫颖禧,曾丽霞,陈肖瑜,罗文奇,黄 静,马 韵
甲状腺癌是常见的内分泌恶性肿瘤之一,包含多种病理类型,其中甲状癌乳头状癌是最常见的类型[1-2]。纺锤体与着丝粒相关蛋白3(spindle and kinetochore associated protein 3, SKA3)参与介导动粒与微管的相互作用,并调节细胞的增殖和凋亡。SKA3在肿瘤中过表达,且与肿瘤细胞增殖和患者预后有关[3-4]。目前尚无SKA3在甲状腺癌中的研究报道。本实验通过免疫组化和多个甲状腺乳头状癌研究队列的大数据,分析SKA3在甲状腺乳头状癌中的表达、预后及其分子意义。
1 材料与方法
1.1 材料收集2019年6月~2020年4月广西医科大学附属肿瘤医院存档的行根治术的甲状腺组织标本,包括21例甲状腺乳头状癌和16例正常甲状腺组织。本实验经广西医科大学附属肿瘤医院医学伦理委员会审批,所有患者均知情同意。
1.2 免疫组化免疫组化染色采用SP法检测系统(北京中杉金桥公司,SP-9000),SKA3抗体(Bioss公司,1 ∶800稀释,bs-7848R)。实验步骤严格按试剂盒说明书操作,EDTA抗原修复液修复。结果判读:着色强度呈浅黄色为1分,黄色为2分,黄褐色为3分,无阳性着色为0分;阳性细胞比例<10%为0分,10%~25%为1分,26%~50%为2分,51%~75%为3分,>75%为4分。上述两项结果乘积作为SKA3最终表达结果。分析人类蛋白质表达图谱(https://www.proteinatlas.org)中SKA3抗体(HPA039272)在20种肿瘤组织切片中的阳性率。
1.2 数据来源甲状腺乳头状癌队列分别来自基因芯片公共数据库(Gene Expression Omnibus, GEO)(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds)的GSE3467队列和GSE33630队列;癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)(https://portal.gdc.cancer.gov)的THCA队列。GSE3467和GSE33630队列的基因表达芯片数据分别包含17例(肿瘤7例、配对正常标本7例)和90例(肿瘤45例、配对对照标本45例)。THCA队列的RNA测序数据和临床数据包含572例样本(肿瘤513例、对照标本59例)。……
