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密叶红豆杉SSR位点分布特征及分子标记开发

2021-04-22

中南林业科技大学学报 2021年4期

(中南林业科技大学 林木遗传育种实验室,湖南 长沙 410004)

密叶红豆杉Taxus fuana是西喜马拉雅山脉特有的常绿裸子植物,近些年才确定了其分类地位[1-3]。密叶红豆杉分布于阿富汗东部、巴基斯坦北部沿喜马拉雅山脉向东达印度西北部、尼泊尔中部和中国西藏的西南部海拔2 500~3 400 m 地带[4-7]。与同属的其它物种相比,它是红豆杉属植物中现实分布区最小,种群数量最少的多年生异交树种。密叶红豆杉心材木质坚硬、色泽红润,其所含的内生真菌产生的代谢产物具有明显的防癌活性,是珍贵的用材和药用树种[8-10]。由于当地居民对野生植物保护意识不强,密叶红豆杉遭盗伐较为严重,随时都有濒临灭绝的风险,被列为我国重点Ⅰ级保护野生植物名录[11]和《全国极小种群野生植物拯救保护工程规划》的120 种极小种群野生植物之一。因此,开展密叶红豆杉种群遗传资源保育工作已刻不容缓。

植物种群遗传资源保育面临的主要障碍之一是缺乏对其遗传多样性全面认识,研究的严重滞后制约了对种群制定合理有效的保护、保存和利用策略[12]。微卫星(Simple sequence repeat,SSR)标记与其它分子标记相比,在不同群体和个体间表现出相对较高的序列变异性,且具有共显性特征,是种群遗传资源保育研究的首选标记之一[13-14]。在林木中应用SSR 标记的难点在于其引物开发,现今由于测序技术进步,兴起从转录组数据中开发SSR 引物[15],但有关密叶红豆杉SSR特异引物的开发尚未见报道。

用于密叶红豆种群遗传学研究的SSR 标记引物数量的不足,将不利于密叶红豆杉遗传资源保育工作开展。……

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