DNA羟甲基化在环境流行病学中的研究进展
2021-04-17付铭白岩森郭欢
付铭,白岩森,郭欢
华中科技大学同济医学院公共卫生学院劳动卫生与环境卫生学系,湖北 武汉 430030
环境污染对人类健康产生了极为深刻的影响,据世界卫生组织统计,仅2012年全球约有1 260 万人的死亡归因于空气、水和土壤污染以及气候异常变化等环境因素,占全球死亡总数的23%[1]。研究表明,环境暴露可通过表观遗传机制影响人体健康[2],其中DNA 甲基化的主要形式5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5mC)作为表观遗传修饰的重要指标,能够响应多种环境因素的改变,在预测环境污染所致的疾病进程中具有现实意义[3]。5mC 的氧化产物5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,5hmC)不仅是DNA 主动去甲基化的中间产物,也是一种稳定的表观遗传标记[4]。正常的5hmC 水平对维持细胞稳态和个体生长发育十分关键,现已在恶性肿瘤、神经系统疾病、心血管系统疾病等多种重大慢性疾病中发现了基因组5hmC 水平的异常变化。研究提示环境因素可能通过影响基因组5hmC 的模式参与调控疾病的发生发展,并且5hmC 在指示某些外界环境因素暴露导致的健康效应变化方面可能比5mC 更加敏感[5]。因此,本文以5hmC 为中心,整合目前环境因素引起5hmC 改变的证据,总结5hmC 与部分重大慢性病关联的研究现状,提出尚存在的科学问题,展望研究方向,以期为环境分子流行病学研究提供新思路。
1 5hmC背景简述
1.1 5hmC的生成与DNA主动去甲基化
5hmC 是5mC 在TET(ten-eleven translocation)蛋白的氧化作用下生成的[6]。TET 蛋白是一类α-酮戊二酸(α-ketoglutarate,α-KG)和Fe2+依赖的双加氧酶,有TET1、TET2 和TET3 三个成员[7]。TET 将5mC 氧化为5hmC 后,还可进一步作用于5hmC 将其连续氧化成5-醛基胞嘧啶(5-formylcytosine,5fC)和5-羧基胞嘧啶(5-carboxylcytosine,5caC)[8]。……
