长链非编码RNA与mRNA在急性髓性白血病中的异常表达及其功能初探
2021-04-15吴晗恬吉布强夏昭林
田 薇,方 延 ,吴晗恬,吉布强,夏昭林
(1.新疆医科大学公共卫生学院,新疆乌鲁木齐 830011;2.复旦大学公共卫生学院,上海 200032;3.山东省临沂市人民医院血液科,山东 临沂 276100)
急性白血病按照法、美、英分型系统(French-American-British classification systems,FAB)分型,主要分为急性髓性白血病(acute myeloid leukemia,AML)和急性淋巴细胞白血病。其中AML是以骨髓和外周血中未成熟骨髓干细胞恶性增生为特征,并具有高度异质性的恶性肿瘤,发生机制尚在研究中。由于AML治愈率不高,且存活率低,治疗后存在复发的特点,因此研究和探索其分子生物学机制,发现新的生物标志极其重要。
近年来长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)逐渐成为表观遗传研究热点。以往认为lncRNA 没有功能,最新研究表明其在基因组中被广泛转录并在基因调节中起重要作用,lncRNA可能存在序列和空间结构上的异常、表达水平的异常及与结合蛋白相互作用的异常等,从而导致基因调节异常而发生疾病。目前lncRNA 最重要的发现是可能与恶性肿瘤的发生相关,不少研究显示在乳腺癌、肝癌、前列腺癌、肺癌中lncRNA的表达水平有明显变化。
LncRNA 在血液肿瘤发生过程中所起的作用目前尚不清楚,其分子遗传及表观遗传学机制还需要进一步探讨。本研究采用lncRNA 基因芯片筛选AML 患者与健康对照组人群外周血中差异表达的lncRNAs 及mRNAs,并对所筛选出的差异表达lncRNAs和mRNAs进行基因本体(gene ontology,GO)分析和通路分析,探讨可能的分子功能及差异表达基因可能所在的细胞通路,对AML中的差异基因进行生物信息学的初步功能分析。
1 材料与方法
1.1 研究对象
收集AML患者及健康对照组各6例人群外周静脉血。……
