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痰标本mecA 和Sa442 基因的定量PCR 检测结果与MRSA培养结果的关联

2021-04-13蔡骁垚林堃银闫佩毅

上海交通大学学报(医学版) 2021年3期
关键词:检测

蔡骁垚,林堃银,孙 涛,张 立,闫佩毅,金 姝,

1.同济大学附属普陀人民医院中心实验室,上海200060;2.同济大学附属普陀人民医院检验科,上海200060

金黄色葡萄球菌是一种重要的致病菌,耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(methicillin resistant Staphylococcus aureus,MRSA)在金黄色葡萄球菌中的分离率已超过40%[1-2],无菌体液中MRSA培养阳性可以作为MRSA感染的诊断依据。痰标本作为非侵入性标本,其检测对病原学诊断有重要参考意义[3]。因此,痰标本MRSA培养阳性对感染诊断也有重要的参考意义[4]。痰液培养的周期为48~72 h;即便是质谱技术,也需要培养出菌落才能进行质谱鉴定,需时约24 h。聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)可以在数小时内获知是否有MRSA基因的存在,其检测结果早于细菌培养结果;但是,临床对于痰标本MRSA 的PCR 检测结果的指导意义尚不清楚[5]。本研究中,我们定量检测痰标本中MRSA 的耐药基因mecA、金黄色葡萄球菌种基因Sa442,同时进行痰标本的培养,分析定量PCR(quantitative PCR,qPCR)检测结果与细菌培养结果的关联;并通过对耐药基因的定量检测预判细菌培养结果,便于更早期地指导临床诊疗工作。

1 材料与方法

1.1 菌株、试剂及引物

收集2017 年5 月—2018 年5 月同济大学附属普陀人民医院入院送检的痰标本,共筛选出1 775 例合格痰标本。标准菌株ATCC33591,购于美国典型培养物保藏中心(American Type Culture Collection,ATCC),为MRSA标准菌株,常用于抗菌药物研发;细菌基因组DNA 提取试剂盒(DP302)购于天根生化科技(北京)有限公司;UNG 酶和Premix Ex TaqTM(2×)购自瑞士罗氏公司;引物和探针均由上海基康生物技术有限公司合成。

1.2 方法

1.2.1 痰细菌培养鉴定 挑取痰标本的脓性部分涂片,革兰染色,显微镜观察,平均每个低倍(10×)视野下鳞状上皮细胞数<10 个、白细胞>25 个为合格痰标本。……

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