基于生物信息学方法的儿童急性不明确谱系白血病的潜在治疗靶基因筛选
2021-04-13吴任燕郭晓琳洪登礼
吴任燕,郭晓琳,洪登礼,陈 磊
1.上海交通大学基础医学院病理生理学系,细胞分化与凋亡教育部重点实验室,上海200025;2.上海交通大学医学院上海市免疫学研究所,上海200025
急性不明确谱系白血病(acute leukemia of ambiguous lineage,ALAL)是一种罕见的白血病类型,不能清楚地分为淋巴系和髓系,其发病率不到5%。根据2016 年世界卫生组织(World Health Organization,WHO)分类标准[1],ALAL 可分为多个亚型,包括急性未分化白血病(acute undifferentiated leukemia,AUL)、混合表型急性白血病(mixed phenotype acute leukemia,MPAL)等。尽管大多数白血病已经得到了很好的研究和治疗,但由于ALAL 的罕见性,目前普遍采用的是与急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)和急性淋巴细胞白血病(acute lymphoblastic leukemia,ALL)相同的治疗手段,无法对ALAL 进行针对性治疗,使得ALAL 相 较 于AML/ALL 治 疗 效 果 较 差[2-3]。因 此 探 究ALAL 发生和生存相关的基因和信号通路,有助于对ALAL发病机制的针对性研究,可为ALAL的临床治疗提供参考。
目前已有的研究主要针对ALAL的存活率、免疫分型以及相关microRNA 而开展。白血病生存分析[4-5]显示,大多数ALAL患者首选ALL的治疗方案;免疫表型分析[6]显示,早期T细胞前体淋巴细胞白血病和T/M-MPAL在免疫表型上相似,NOTCH1可作为T 细胞混合表型白血病的潜在治疗靶点;通过高通量测序,ALAL可以根据具有谱系特性的microRNA 表达特性被归类为AML 或ALL[7]。这些研究大多探讨了ALAL与其他白血病的谱系关系,但有关ALAL独特的基因表达谱、生存基因以及相关通路尚不清楚。高通量测序技术自问世以来,极大地推动了对于疾病标志物的研究进展。通过对公共数据库数据的生物信息学分析,我们可以对疾病的发病机制及治疗靶标进行预测,为疾病的机制研究和药物研发提供思路。……