贵州山核桃转录组文库构建与测序
2021-03-31郭计华苗贵东桂腾琴邱国俊夏可灿
种子 2021年2期
郭计华, 苗贵东, 姜 丽, 桂腾琴, 张 培, 邱国俊, 夏可灿
(兴义民族师范学院, 贵州 兴义 562400)
山核桃(CaryacathayensisSarg.)为胡桃科 (Juglanaceae)山核桃属(CaryaNutt.)双子叶植物[1],广泛种植于北美和亚洲东南部,在我国主要分布在浙江、安徽、湖南、贵州,全世界共约19种。山核桃不仅营养价值高、用途广,还有养颜、保健及药用等价值,且富含人体所需的矿质元素[2];山核桃的核仁和干果均可加工制作成各种糖果糕点等产品[3]。
由于山核桃品种良莠不齐、品种单一,再加上管理粗放,严重制约了山核桃产业的发展[4]。如何快速筛选和培育优良山核桃品种是育种团队面临的重要课题。目前,对山核桃的研究主要集中在果实营养品质、繁殖栽培方法、生产开发以及新品种选育等方面[5],有关分子水平上的研究报道较少,尤其关于中国特有物种贵州山核桃在分子水平上的研究尚未见报道。随着求。根据其以往数据统计,对于A类样品,单次建库成功率95%以上。

表1 RNA样品的纯度与浓度
高通量转录组测序技术的迅猛发展[6],为山核桃基因高效挖掘,实施分子辅助育种计划,提供了一个崭新的平台和巨大的发展机遇。
关于贵州山核桃的研究,仅在邓朝义1994年发表的《贵州山核桃属植物的研究》中初见报道[7]。贵州山核桃是一种没有参考基因组资源的非模式物种。在本研究中,为了进一步摸清贵州山核桃的分子遗传机理,首次将高通量测序技术应用到贵州山核桃中,首次获得贵州山核桃的重新转录组数据,为今后开展贵州山核桃重要品质性状基因挖掘[8]、功能标记开发,辅助山核桃优异性状基因型选择,聚合优异等位基因,为实现全基因组水平育种提供理论依据。……
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