2020年12月，中国科技信息研究所在北京发布《2020中国科技期刊引证报告》，《中国药理学通报》核心影响因子1.423(2/48)，总被引频次3537(3/48)，基金论文比0.94(1/48)，综合评价总分63.22(2/48)。

另据《中国学术期刊影响因子年报(2020版)》公布：本刊复合影响因子2.003(2/69)，综合影响因子1.633(2/69)，基础研究影响因子1.567(2/69)，影响力指数(CI)879.725(2/69)，四项指标均列69种药学期刊第二名。