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1例输入性HIV-1 G亚型毒株的检出及基因组序列分析

2021-03-25罗周正马玉霞刘文新田晓东

传染病信息 2021年1期

杜 波,李 贺,罗周正,马玉霞,刘文新,赵 地,吴 莹,郭 勇,田晓东

HIV-1为反转录病毒属正链RNA病毒,由于病毒复制过程缺少校对功能,具有高度变异性。HIV-1除少数为N组和O组外,大部分属于M组,而M组又可分为9个亚型和102个重组亚型[1-2]。随着基因测序技术的进步,越来越多的HIV基因组得到测序,这为分析HIV亚型、流行趋势、分子溯源提供基础数据,也对制定有效的艾滋病防治措施提供科学依据[3-5]。HIV-1亚型中,G亚型主要分布于西非和欧洲,其感染者只占全球感染者的4.6%;但G亚型出现时间较长,随着病毒的变异和重组,G亚型与HIV-1其他亚型重组产生的重组亚型广泛流行。例如,重组亚型CRF02_AG就是由HIV-1 A亚型和G亚型重组而成,CRF02_AG重组亚型感染者占全球感染者的7.7%[6]。

阜新地区流行的HIV-1毒株亚型呈现复杂趋势。2009年以前,主要以B亚型感染为主;2009年以后,以CRF01_AE亚型感染居多,亚型种类包括B亚型、CRF07_BC亚型和CRF65_cpx亚型,但之前本地区未发现过G亚型。在2019年的艾滋病监测中,首次监测到本地区有1例输入性HIV-1 G亚型感染者,本文对其体内的HIV-1基因组进行序列测定和进化分析,为本病例病毒溯源提供依据,也为本地区HIV-1流行趋势提供预测。现报道如下。

1 对象与方法

1.1 对象 本病例来自阜新市卫生健康服务中心(阜新市疾病预防控制中心)艾滋病监测人群,为艾滋病WHO临床分期I期的尼日利亚来华人员,血清样本编号FX2019042,经ELISA、胶体金筛查和免疫印迹确证试验确认为HIV-1抗体阳性。在确保患者知情同意的前提下,采集患者血清2 ml,冻存于-70 ℃冰箱备用。

1.2 HIV-1 RNA提取 采用RNA病毒提取试剂盒QIAamp Viral RNA Mini Kit(QIAGEN公司,货号52904)提取血清样品中的HIV-1 RNA,具体操作严格按照说明书进行。……

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