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vvi-miR172s及其靶基因响应赤霉素调控葡萄果实发育的作用分析

2021-03-25宣旭娴盛子璐解振强黄雨晴巩培杰张川郑婷王晨房经贵

中国农业科学 2021年6期

宣旭娴,盛子璐,解振强,黄雨晴,巩培杰,张川,郑婷,王晨,房经贵

vvi-miR172s及其靶基因响应赤霉素调控葡萄果实发育的作用分析

宣旭娴1,盛子璐1,解振强2,黄雨晴1,巩培杰1,张川1,郑婷1,王晨1*,房经贵1

1南京农业大学园艺学院,南京 210095;2江苏农林职业技术学院,江苏句容 212499

【】miR172是植物生长发育的重要调节因子,阐释vvi-miR172s及其靶基因应答赤霉素在葡萄果实不同组织发育过程中的作用,从miRNA角度认识GA调控葡萄果实发育的作用机制。以‘白罗莎里奥’葡萄为材料,以miR-RACE和PCR技术克隆vvi-miR172a/b/c/d的成熟体和前体序列,由psRNA Target软件预测vvi-miR172s的靶基因;利用RLM-RACE技术验证vvi-miR172s剪切靶基因的裂解作用及其作用位点;采用生物信息学软件对靶基因、靶蛋白进行系统进化、序列结构分析及亚细胞定位预测;通过在线软件PLANTCARE进行启动子作用元件分析;通过qRT-PCR和芯片数据分析vvi-miR172s和靶基因在不同器官、不同发育阶段的基因表达图谱,以及应答GA3在果实不同组织中的时空表达模式。克隆鉴定了vvi-miR172a/b/c/d的成熟体和前体序列,预测到和四个靶基因,验证到裂解产物及其裂解位点,证明它们为vvi-miR172s的真实靶基因。序列结构分析显示,均含有10个外显子和9个内含子,其motif元件的种类和数量相似,均含有两个排列顺序相近的AP2蛋白结构域,表明其结构和功能具有一定的保守性;且、和与杨树的亲缘关系较近,与大豆具有较高的同源性;靶基因蛋白二级结构均为-螺旋,可进一步折叠为稳定的三级结构;4个靶蛋白亚细胞定位主要位于细胞核内。启动子作用元件分析发现vvi-miR172c和中含有赤霉素响应元件,表明它们可能响应赤霉素调控葡萄生长发育;……

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