杨灿 沃恩康 杨新燕 徐琦 杨柳 邓冠聪 路鑫怡 郭潮潭

杭州医学院生物工程研究所310013

甲型流感病毒极易变异，宿主广泛，能通过呼吸道在人群中迅速传播，引起全球范围内的季节性大流行[1]。 甲型流感病毒感染会导致宿主细胞变性、坏死乃至脱落，造成黏膜充血、水肿和分泌物增加，从而产生鼻塞、流涕、咽喉疼痛、干咳以及其他上呼吸道感染症状，当病毒蔓延至下呼吸道，则能引起毛细支气管炎和间质性肺炎，严重的肺损伤可导致器官衰竭或死亡，这也是感染者死亡的主要原因[2]。现阶段针对甲型流感病毒所致严重性肺炎最主要的防控措施依然是提前接种疫苗。 尽管接种疫苗和抗病毒药物对流感有效，但鉴于流感病毒株的易突变特性，探索它们引起肺损伤的共同机制，能为更有力的预防和更为精准的治疗提供依据。 Gene Expression Ominbus（GEO）是一个公共的基因组学研究数据库，包含了大量的基因表达、芯片和微阵列数据。 本研究拟运用GEO 数据，采用生物信息学方法分析甲型流感病毒所致肺损伤的可能机制，现报道如下。

资料与方法

一、微阵列资料数据获取

从GEO 中筛选并下载3 个基因表达数据集：GSE57455、GSE63786 和GSE64800。GSE57455 包含3 个未感染和3 个感染A/Hong Kong/X31（H3N2）病毒的肺组织样本；GSE63786 包含3 个未感染和3个感染A/California/04/09 （H1N1） 病毒的肺组织样本；GSE64800 包含3 个未感染和3 个感染A/Hong Kong/213/03（H5N1）病毒的肺组织样本。

二、方法

1.差异表达基因（DEGs）数据处理

使用NCBI 官方数据分析工具GEO2R（http：//www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/GEO2R） 对感染和非感染甲型流感病毒的肺组织样本进行DEG 分析。 以P＜0.01 且| logFC |≥1 作为筛选的前置标准。……