APP下载

紫苏叶绿体全基因组特征分析

2021-03-18许冬梅贾小云王文斌

山西农业科学 2021年3期

梁 璇,李 鹏,许冬梅,贾小云,王文斌

(山西农业大学生命科学学院,山西太谷 030801)

紫苏(Perilla frutescens(L.)Britton)又名赤苏、红紫苏、香苏,是唇形科紫苏属下的唯一种,一年生草本植物,是我国传统的药食两用植物,具有超过2 000 a 的栽培历史。紫苏的茎、叶和种子均可入药,其叶又称苏叶,具有解表散寒、行气和胃功效;其果实紫苏子具有降气消痰、平喘、润肠功效;紫苏梗有理气宽中、止痛、安胎功效。

叶绿体是植物体内重要的细胞器,不仅通过光合作用为植物的生长发育提供必要能量,还拥有半自主性遗传的基因组,可进行半保留复制。同核基因组相比,叶绿体基因组长度较短,易于提取纯化,且序列高度保守,SSR 位点丰富,在揭示物种起源、进化演化及确定不同物种之间的亲缘关系等方面具有重要的参考价值[1]。因此,对紫苏叶绿体基因组的特征分析是后续系统发育研究和基因工程研究的前提。近年来,关于不同物种叶绿体基因组的研究日益增多,已有1 000 多种叶绿体基因组序列被公布,如蒙古韭[2]、黄芩[3]、紫花苜蓿[4]、竹子[5]等。这些研究均对不同物种的叶绿体基因组进行了SSR 分布规律、密码子使用频率、密码子偏好性及RNA 编辑位点等多方面的分析,但是目前为止关于紫苏叶绿体基因组的研究分析还鲜有报道。

有研究发现,被子植物叶绿体基因组DNA(Chloroplast DNA,cpDNA)多为闭合的双链环状四分体结构,包括一个大单拷贝区(Large Single Copy,LSC)和一个小单拷贝区(Small Single Copy,SSC)以及2 个序列相同但方向相反的反向重复区(Inverted Repeat,IRA 和IRB),且IR 和单拷贝区交替排列[3]。……

登录APP查看全文